More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1624 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  591  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  82.93 
 
 
287 aa  498  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  71.08 
 
 
287 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  67.94 
 
 
301 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  66.9 
 
 
287 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  66.55 
 
 
287 aa  403  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  67.6 
 
 
284 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  63.07 
 
 
297 aa  378  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  62.81 
 
 
289 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  55.78 
 
 
299 aa  293  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  56.69 
 
 
303 aa  289  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  56.59 
 
 
297 aa  285  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  48.79 
 
 
292 aa  283  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  49.32 
 
 
288 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  50.36 
 
 
299 aa  278  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  52.34 
 
 
279 aa  276  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  52.57 
 
 
291 aa  275  9e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  48.31 
 
 
288 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  47.14 
 
 
292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  52.53 
 
 
285 aa  271  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  49.81 
 
 
276 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  49.81 
 
 
279 aa  270  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  52.69 
 
 
274 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  52.31 
 
 
268 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  49.24 
 
 
272 aa  267  2e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  48.43 
 
 
301 aa  265  5e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  50.38 
 
 
268 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  50.38 
 
 
284 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  50.94 
 
 
305 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  49.81 
 
 
288 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  48.3 
 
 
288 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  48.51 
 
 
285 aa  249  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  50.2 
 
 
275 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  47.21 
 
 
302 aa  248  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  49.24 
 
 
283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  47.13 
 
 
304 aa  237  1e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  48.68 
 
 
299 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  48.85 
 
 
279 aa  235  8e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  45.35 
 
 
318 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  46.27 
 
 
318 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  46.67 
 
 
292 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  46.67 
 
 
315 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  46.67 
 
 
292 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  47.51 
 
 
342 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  46.27 
 
 
319 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  47.95 
 
 
342 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  46.27 
 
 
319 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  46.27 
 
 
319 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  46.48 
 
 
282 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  44.65 
 
 
261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  45.7 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  42.49 
 
 
288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  44.44 
 
 
296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  42.8 
 
 
291 aa  219  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  47.48 
 
 
282 aa  219  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  45.2 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  41.29 
 
 
294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  43.82 
 
 
276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  44.02 
 
 
270 aa  214  9.999999999999999e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  45.9 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  53.76 
 
 
175 aa  202  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  44.67 
 
 
251 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  58.21 
 
 
147 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  51.45 
 
 
273 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  53.74 
 
 
252 aa  158  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  53.06 
 
 
252 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  43.12 
 
 
239 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  53.06 
 
 
252 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  53.06 
 
 
252 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  53.42 
 
 
252 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  39.64 
 
 
245 aa  156  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  52.94 
 
 
263 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  46.96 
 
 
317 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  45.86 
 
 
247 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  48.57 
 
 
241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  46.41 
 
 
317 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  45.86 
 
 
317 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  46.07 
 
 
247 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  51.02 
 
 
252 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  46.07 
 
 
247 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  51.02 
 
 
252 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  46.07 
 
 
218 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  50.34 
 
 
249 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  41.74 
 
 
263 aa  149  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  48.65 
 
 
216 aa  149  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  42.86 
 
 
261 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  44.2 
 
 
262 aa  149  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  50.34 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  48.98 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  48.3 
 
 
239 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  51.02 
 
 
241 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  49.66 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  49.66 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  48.3 
 
 
239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  49.66 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  49.66 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  49.66 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  49.66 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  49.66 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0567  hypothetical protein  46.29 
 
 
242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.892575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>