More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1611 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1611  patatin  100 
 
 		 327 aa  642    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  80.53 
 
 		 298 aa  417  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  63.64 
 
 		 308 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  54.61 
 
 		 311 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  54.58 
 
 		 316 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  52.19 
 
 		 318 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  55.16 
 
 		 318 aa  288  8e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  51.25 
 
 		 319 aa  286  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  55.68 
 
 		 323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  51.96 
 
 		 315 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  51.8 
 
 		 358 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  52.4 
 
 		 358 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  52.31 
 
 		 317 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  53.23 
 
 		 306 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  53.23 
 
 		 305 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  53.26 
 
 		 302 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  53.23 
 
 		 305 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  51.26 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  51.26 
 
 		 474 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  53.28 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  51.26 
 
 		 347 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  51.26 
 
 		 347 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  51.26 
 
 		 347 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  52.87 
 
 		 302 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  53.88 
 
 		 349 aa  276  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  54.26 
 
 		 301 aa  272  6e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  50.54 
 
 		 293 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  76.02 
 
 		 223 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  47.65 
 
 		 347 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  47.65 
 
 		 347 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  49.8 
 
 		 330 aa  241  7.999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  51.59 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  45.39 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  45.14 
 
 		 346 aa  236  4e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  45.94 
 
 		 348 aa  235  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  47.25 
 
 		 345 aa  232  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  49.21 
 
 		 346 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1099  Patatin  52.34 
 
 		 216 aa  208  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  38.53 
 
 		 335 aa  192  8e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  42.15 
 
 		 333 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  40.92 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  41.76 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  41.92 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  41.43 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  36.72 
 
 		 334 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1250  Patatin  42.62 
 
 		 315 aa  169  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  34.94 
 
 		 256 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  35.74 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  38.15 
 
 		 273 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2248  patatin  36.99 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000483093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  36.71 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  46.7 
 
 		 335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  39.22 
 
 		 262 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  36 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  35.39 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  36.9 
 
 		 276 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  36.13 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  34.95 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  35.62 
 
 		 263 aa  146  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  34.08 
 
 		 275 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  36.76 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  35.74 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  35.62 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  35.18 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  35.19 
 
 		 263 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  35.19 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  35.19 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  35.19 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  35.19 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  38.4 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  36.13 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  36.13 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  34.93 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  34.76 
 
 		 263 aa  142  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  33.89 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  45.45 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  36.19 
 
 		 748 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  34.35 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  46.2 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  34.67 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  33.33 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  32.3 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  33.45 
 
 		 751 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  42.22 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  34.55 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  33.1 
 
 		 728 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  34.74 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  35.76 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  35.77 
 
 		 262 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  32.98 
 
 		 728 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  32.33 
 
 		 275 aa  136  5e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  42.78 
 
 		 341 aa  136  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  33.75 
 
 		 317 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  33.33 
 
 		 316 aa  135  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  33.33 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  34.15 
 
 		 728 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  41.32 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2220  Patatin  41.63 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0960823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  32.06 
 
 		 727 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  40.11 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>