37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1580 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1580  NifZ family protein  100 
 
 		 103 aa  206  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1451  hypothetical protein  58.14 
 
 		 91 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482298 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  60.81 
 
 		 82 aa  87.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1252  NifZ family protein  55.13 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1536  NifZ domain protein  55.13 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0210  nifZ protein, putative  58.67 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000650031  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0117  NifZ family protein  51.95 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5898  hypothetical protein  57.69 
 
 		 82 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00590287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4467  NifZ  57.53 
 
 		 76 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1069  hypothetical protein  55.41 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5105  NifZ family protein  56.94 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0965  NifZ  58.9 
 
 		 85 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1410  NifZ protein, putative  51.35 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3640  NifZ family protein  55.71 
 
 		 79 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.231555 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  40.85 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3957  NifZ  37.33 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000304465  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  33.33 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1394  NifZ  35.37 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0463497  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1775  NifZ family protein  36.11 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7746  hypothetical protein  52.17 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1803  NifZ family protein  36.11 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1068  NifZ  38.67 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3599  NifZ family protein  37.04 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0964  NifZ  37.33 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4479  NifZ  43.84 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.248929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5899  nitrogen fixation protein NifZ  35.63 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0192741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2128  NifZ family protein  39.19 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2368  NifZ family protein  35.21 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1409  NifZ family protein  36.59 
 
 		 111 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0116  NifZ family protein  37.18 
 
 		 108 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.780369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5106  NifZ family protein  34.12 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  36.11 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1579  NifZ family protein  40.48 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4009  NifZ family protein  33.33 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0277  NifZ family protein  35.14 
 
 		 321 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0714464  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0401  NifZ family protein  40.82 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3641  NifZ family protein  36.25 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>