More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1536 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 449 aa  893    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.35 
 
 		 458 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.63 
 
 		 450 aa  524  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  60 
 
 		 450 aa  483  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.45 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5865  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.33 
 
 		 462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3012  histidine kinase  54.27 
 
 		 475 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  45.22 
 
 		 519 aa  352  8e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  38.6 
 
 		 449 aa  269  7e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  37.89 
 
 		 471 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  37.37 
 
 		 471 aa  244  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 433 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  32.53 
 
 		 467 aa  242  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  35.62 
 
 		 457 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  36.11 
 
 		 457 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  34.6 
 
 		 478 aa  232  8.000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  34.6 
 
 		 478 aa  233  8.000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 438 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  35.27 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  35.27 
 
 		 438 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  35.27 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  35.27 
 
 		 438 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  35.27 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  35.27 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  35.27 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 480 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 448 aa  226  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 444 aa  226  8e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 445 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0135  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 455 aa  222  8e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0665221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.52 
 
 		 433 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  37.45 
 
 		 472 aa  219  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 453 aa  219  7.999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  33.92 
 
 		 442 aa  219  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4241  sensor protein QseC  34.35 
 
 		 449 aa  217  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 433 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  35.19 
 
 		 441 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 466 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1941  histidine kinase  37.2 
 
 		 514 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.531292  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3681  hypothetical protein  35.27 
 
 		 455 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.740643 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4531  sensor protein QseC  34 
 
 		 449 aa  210  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0682388  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 448 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  32.49 
 
 		 455 aa  209  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 450 aa  209  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.96 
 
 		 513 aa  207  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  33.78 
 
 		 459 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  38.48 
 
 		 499 aa  207  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  36.68 
 
 		 501 aa  205  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 531 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 448 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  34.51 
 
 		 448 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 448 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4830  two-component regulatory system sensory histidine kinase  31.72 
 
 		 457 aa  203  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00276208  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2077  signal transduction histidine kinase sensor  30.25 
 
 		 487 aa  202  7e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 475 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4905  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 467 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 466 aa  200  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  31.39 
 
 		 526 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  34.5 
 
 		 452 aa  200  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1338  sensor histidine kinase  32.97 
 
 		 452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  36.68 
 
 		 505 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  36.68 
 
 		 505 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  37.36 
 
 		 523 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  36.68 
 
 		 505 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  36.68 
 
 		 505 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 461 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4242  ATP-binding region, ATPase-like  33.57 
 
 		 463 aa  196  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 481 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 446 aa  196  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  33.19 
 
 		 467 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  32.58 
 
 		 454 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  38.01 
 
 		 518 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3460  sensor protein QseC  32.97 
 
 		 449 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 454 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 517 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  37.36 
 
 		 518 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 515 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 450 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.483241  normal  0.593918 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02898  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with QseB  32.75 
 
 		 449 aa  193  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.760394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0674  histidine kinase  32.75 
 
 		 449 aa  193  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3204  sensor protein QseC  32.75 
 
 		 449 aa  193  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02848  hypothetical protein  32.75 
 
 		 449 aa  193  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 450 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4358  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 446 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4335  sensor protein QseC  32.75 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3315  sensor protein QseC  32.53 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0769555 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3491  sensor protein QseC  32.75 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  37.36 
 
 		 817 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  35.31 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0671  sensor protein QseC  32.53 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0679985 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0693  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3430  sensor protein QseC  34.84 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 524 aa  190  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 519 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 487 aa  189  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0140  sensor histidine kinase  29.05 
 
 		 471 aa  189  7e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>