More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1505 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  100 
 
 		 360 aa  719    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  78.27 
 
 		 357 aa  565  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  76.63 
 
 		 369 aa  524  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  72.62 
 
 		 357 aa  504  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  71.55 
 
 		 355 aa  498  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000666487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  71.13 
 
 		 354 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  71.43 
 
 		 357 aa  497  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  71.13 
 
 		 357 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  71.13 
 
 		 357 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  71.13 
 
 		 357 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  71.13 
 
 		 354 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  70.83 
 
 		 357 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  70.33 
 
 		 356 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  70.03 
 
 		 354 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  70.24 
 
 		 421 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  70.03 
 
 		 354 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  70.03 
 
 		 356 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  68.42 
 
 		 357 aa  484  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  70.24 
 
 		 385 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  67.55 
 
 		 358 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  69.94 
 
 		 389 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  67.89 
 
 		 356 aa  478  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  67.32 
 
 		 356 aa  475  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3450  selenophosphate synthetase  70.47 
 
 		 351 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111292  normal  0.645552 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3716  selenophosphate synthetase  70.47 
 
 		 351 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  69.32 
 
 		 671 aa  469  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  67.85 
 
 		 354 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3250  selenophosphate synthetase  69.35 
 
 		 351 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.433054  normal  0.299232 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  66.27 
 
 		 353 aa  463  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4627  selenophosphate synthetase  68.44 
 
 		 353 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173949  normal  0.0779363 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  66.27 
 
 		 354 aa  456  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1054  selenophosphate synthetase  66.07 
 
 		 348 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  66.67 
 
 		 389 aa  442  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  61.67 
 
 		 359 aa  442  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  64.24 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  61.61 
 
 		 346 aa  418  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3330  selenide, water dikinase  59.82 
 
 		 348 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.456858 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2723  selenophosphate synthetase  60.93 
 
 		 347 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  57.27 
 
 		 350 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  57.65 
 
 		 349 aa  385  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0666  selenide, water dikinase  57.65 
 
 		 350 aa  381  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  56.42 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5393  selenide, water dikinase  55.95 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6116  selenide, water dikinase  55.22 
 
 		 349 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  53.07 
 
 		 352 aa  335  9e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  53.07 
 
 		 352 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2720  selenide, water dikinase  53.25 
 
 		 347 aa  333  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0793  selenide, water dikinase  55.38 
 
 		 344 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  52.45 
 
 		 352 aa  332  8e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0823  selenophosphate synthetase  54.75 
 
 		 344 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  0.0506627 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  53.12 
 
 		 352 aa  331  9e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  53.12 
 
 		 352 aa  331  9e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0850  selenophosphate synthetase  54.43 
 
 		 344 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  52.91 
 
 		 351 aa  330  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  52.82 
 
 		 352 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  52.15 
 
 		 352 aa  330  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4363  selenophosphate synthetase  52.69 
 
 		 344 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.040516  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  52.82 
 
 		 352 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0696  selenophosphate synthetase  55.02 
 
 		 344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  52.44 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2455  selenophosphate synthetase  51.61 
 
 		 344 aa  326  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0864  selenophosphate synthetase  53.8 
 
 		 344 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2089  selenophosphate synthetase  53.25 
 
 		 348 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1980  selenophosphate synthetase  53.25 
 
 		 348 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196401  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3755  selenophosphate synthetase  53.16 
 
 		 344 aa  322  7e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2344  selenophosphate synthetase  53.25 
 
 		 348 aa  322  7e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000222806  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3631  selenophosphate synthetase  50.15 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  50.77 
 
 		 351 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43280  selenophosphate synthetase  50.44 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.823398 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3543  selenophosphate synthetase  54.4 
 
 		 352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  52 
 
 		 347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1391  selenophosphate synthetase  51.63 
 
 		 347 aa  318  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.472667  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2049  selenophosphate synthetase  51.63 
 
 		 347 aa  318  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25484  normal  0.757262 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1408  selenophosphate synthetase  51.63 
 
 		 347 aa  318  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00232464  normal  0.656366 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1022  selenophosphate synthetase  47.28 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000499112  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1878  selenophosphate synthetase  51.63 
 
 		 347 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000766912  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1424  selenophosphate synthetase  51.63 
 
 		 347 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.583655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  52.17 
 
 		 351 aa  318  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  52 
 
 		 347 aa  315  7e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  52 
 
 		 347 aa  315  7e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  50.46 
 
 		 346 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  51.69 
 
 		 347 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  51.69 
 
 		 347 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  51.69 
 
 		 347 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10180  selenophosphate synthetase  49.27 
 
 		 345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  51.69 
 
 		 347 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  50.74 
 
 		 352 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  51.85 
 
 		 347 aa  313  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  51.69 
 
 		 347 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  51.38 
 
 		 347 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  51.38 
 
 		 347 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0768  selenide, water dikinase  48.83 
 
 		 344 aa  311  9e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306081  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  50.31 
 
 		 346 aa  310  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0300  selenophosphate synthetase  49.7 
 
 		 347 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1896  selenide, water dikinase  48.65 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2397  selenide, water dikinase  48.77 
 
 		 353 aa  298  9e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0511  selenophosphate synthase  49.27 
 
 		 345 aa  297  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0641838  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3011  selenide, water dikinase  45.61 
 
 		 359 aa  293  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  47.65 
 
 		 351 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  51.16 
 
 		 316 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>