60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1482 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1482  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  100 
 
 
170 aa  349  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.469356 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1941  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  60.98 
 
 
147 aa  147  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0206301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  41.1 
 
 
141 aa  94.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.411404  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.66 
 
 
162 aa  94  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15765  normal  0.357312 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03637  Potential redox protein  40.37 
 
 
131 aa  90.5  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223227  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0715  hypothetical protein  37.17 
 
 
133 aa  88.6  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15521  hypothetical protein  37.17 
 
 
137 aa  88.2  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0201  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  44.25 
 
 
288 aa  87.8  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4062  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.21 
 
 
141 aa  87.4  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0170887  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1838  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.93 
 
 
160 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0931  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.61 
 
 
130 aa  82.4  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2077  hypothetical protein  35.96 
 
 
138 aa  82  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.949648 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000970  cell division inhibitor  33.58 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1840  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.21 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3218  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.18 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00144282  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3626  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.09 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.95092  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0610  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.09 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3684  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.18 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.316801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0121  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.98 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1860  hypothetical protein  37.1 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2894  hypothetical protein  43.36 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000016603  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11891  hypothetical protein  37.39 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.811967  normal  0.0619225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3808  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.18 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0344386  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1814  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.21 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3850  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.05 
 
 
293 aa  74.3  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.386494 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07021  hypothetical protein  34.86 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0181  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  39.83 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385017  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0675  hypothetical protein  37.17 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.916492  normal  0.175959 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0236  hypothetical protein  37.29 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.368645  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10574  predicted protein  32.56 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0771  hypothetical protein  34.55 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3508  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.55 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281099  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04751  hypothetical protein  31.86 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.154576  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4819  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.05 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2020  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.5 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04441  hypothetical protein  31.86 
 
 
130 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.141762  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5411  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.05 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398056  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5450  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.05 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0615  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.55 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.72548  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3164  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.36 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07171  hypothetical protein  37.17 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3338  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.55 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1605  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.17 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2743  hypothetical protein  35.45 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590114  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0420  hypothetical protein  30.09 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.600155  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04851  hypothetical protein  30.97 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1687  hypothetical protein  36.45 
 
 
134 aa  67.4  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2108  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  32.17 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310466  normal  0.354164 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0517  hypothetical protein  29.57 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.419352  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3208  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.71 
 
 
137 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346323  normal  0.0537298 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2511  hypothetical protein  35.71 
 
 
137 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768135  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5381  hypothetical protein  33.61 
 
 
133 aa  61.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.919604  normal  0.706787 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0568  hypothetical protein  31.36 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1409  hypothetical protein  25.23 
 
 
139 aa  58.2  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32698  predicted protein  25.68 
 
 
770 aa  55.1  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.782214  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2144  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.48 
 
 
128 aa  52.4  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6771  hypothetical protein  32.29 
 
 
124 aa  47.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667149  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0767  hypothetical protein  31.96 
 
 
139 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0353  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1272  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  27.36 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>