More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1464 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1464  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 130 aa  256  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1693  50S ribosomal protein L19  95 
 
 		 121 aa  230  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1107  50S ribosomal protein L19  91.45 
 
 		 117 aa  216  6e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0684  50S ribosomal protein L19  91.38 
 
 		 117 aa  213  5e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1887  50S ribosomal protein L19  86.18 
 
 		 128 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000459449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2700  50S ribosomal protein L19  88.79 
 
 		 127 aa  208  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3352  50S ribosomal protein L19  88.79 
 
 		 127 aa  208  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459545  normal  0.21243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5342  ribosomal protein L19  88.79 
 
 		 146 aa  207  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0827  50S ribosomal protein L19  87.07 
 
 		 128 aa  203  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0807  50S ribosomal protein L19  84.3 
 
 		 128 aa  202  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0878  50S ribosomal protein L19  84.3 
 
 		 128 aa  202  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.714575  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0936  50S ribosomal protein L19  83.47 
 
 		 128 aa  200  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0118366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1476  ribosomal protein L19  85.34 
 
 		 127 aa  200  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1009  50S ribosomal protein L19  81.89 
 
 		 128 aa  197  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3063  50S ribosomal protein L19  77.69 
 
 		 126 aa  196  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.7389400000000002e-23  unclonable  0.0000000280297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2974  50S ribosomal protein L19  81.6 
 
 		 129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185414  normal  0.0681768 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2376  50S ribosomal protein L19  80.17 
 
 		 126 aa  193  8.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.488088 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0772  50S ribosomal protein L19  83.9 
 
 		 127 aa  192  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123982  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2231  50S ribosomal protein L19  83.05 
 
 		 130 aa  191  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133079  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0400  50S ribosomal protein L19  83.05 
 
 		 129 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311266  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2916  50S ribosomal protein L19  83.05 
 
 		 129 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104076  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2537  50S ribosomal protein L19  82.68 
 
 		 127 aa  191  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155158  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2965  50S ribosomal protein L19  83.05 
 
 		 129 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1664  50S ribosomal protein L19  83.05 
 
 		 129 aa  191  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2542  50S ribosomal protein L19  83.05 
 
 		 129 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0263241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0231  50S ribosomal protein L19  83.05 
 
 		 129 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2856  50S ribosomal protein L19  83.05 
 
 		 129 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.878575  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0916  50S ribosomal protein L19  83.05 
 
 		 129 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2784  50S ribosomal protein L19  79.34 
 
 		 135 aa  191  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0520  50S ribosomal protein L19  81.75 
 
 		 129 aa  191  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.228121  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1405  50S ribosomal protein L19  82.79 
 
 		 126 aa  189  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0948  50S ribosomal protein L19  82.2 
 
 		 130 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.757688  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1282  50S ribosomal protein L19  78.63 
 
 		 131 aa  187  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.107761  normal  0.374965 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1031  50S ribosomal protein L19  81.36 
 
 		 130 aa  186  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0751  50S ribosomal protein L19  83.61 
 
 		 130 aa  187  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0952  50S ribosomal protein L19  81.36 
 
 		 130 aa  186  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0593  50S ribosomal protein L19  81.36 
 
 		 130 aa  186  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095314  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1072  50S ribosomal protein L19  81.36 
 
 		 130 aa  186  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242616  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2331  50S ribosomal protein L19  81.82 
 
 		 129 aa  186  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185348  normal  0.0588442 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4186  50S ribosomal protein L19  80.51 
 
 		 130 aa  184  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.105391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0572  50S ribosomal protein L19  76.67 
 
 		 135 aa  180  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0280317  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  73.68 
 
 		 119 aa  168  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0395  50S ribosomal protein L19  68.97 
 
 		 114 aa  167  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0887  50S ribosomal protein L19  68.97 
 
 		 117 aa  167  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00504476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1377  50S ribosomal protein L19  71.93 
 
 		 116 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.134338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16000  50S ribosomal protein L19  71.93 
 
 		 116 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000973438  normal  0.502722 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3398  50S ribosomal protein L19  71.93 
 
 		 116 aa  166  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  69.49 
 
 		 117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  69.49 
 
 		 117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  68.64 
 
 		 117 aa  164  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  69.49 
 
 		 117 aa  162  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39530  50S ribosomal protein L19  71.93 
 
 		 116 aa  162  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0334012  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  67.8 
 
 		 117 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  67.8 
 
 		 117 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  67.8 
 
 		 117 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  67.8 
 
 		 117 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  67.8 
 
 		 117 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  67.8 
 
 		 117 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  67.8 
 
 		 117 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  67.8 
 
 		 117 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  67.8 
 
 		 117 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  67.8 
 
 		 117 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4256  50S ribosomal protein L19  71.05 
 
 		 116 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1465  50S ribosomal protein L19  71.05 
 
 		 116 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0559636  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3767  50S ribosomal protein L19  67.54 
 
 		 120 aa  160  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1070  50S ribosomal protein L19  71.05 
 
 		 116 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2003  ribosomal protein L19  69.57 
 
 		 115 aa  160  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000253757  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  67.8 
 
 		 117 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4154  50S ribosomal protein L19  70.18 
 
 		 116 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237739  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2016  50S ribosomal protein L19  66.13 
 
 		 130 aa  160  8.000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  67.83 
 
 		 131 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1580  50S ribosomal protein L19  66.96 
 
 		 120 aa  158  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2277  50S ribosomal protein L19  69.57 
 
 		 118 aa  158  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122186  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  67.54 
 
 		 117 aa  158  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  66.95 
 
 		 117 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  66.96 
 
 		 120 aa  158  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1476  ribosomal protein L19  69.3 
 
 		 116 aa  157  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1285  50S ribosomal protein L19  69.3 
 
 		 116 aa  157  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  68.7 
 
 		 115 aa  158  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1022  50S ribosomal protein L19  68.7 
 
 		 116 aa  158  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0650  50S ribosomal protein L19  66.96 
 
 		 115 aa  157  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3087  50S ribosomal protein L19  67.24 
 
 		 115 aa  157  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228152  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0527  ribosomal protein L19  66.38 
 
 		 117 aa  157  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2319  50S ribosomal protein L19  65.85 
 
 		 142 aa  157  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.556938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3279  50S ribosomal protein L19  67.52 
 
 		 126 aa  156  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0994  50S ribosomal protein L19  66.96 
 
 		 115 aa  156  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205285  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2857  50S ribosomal protein L19  66.96 
 
 		 115 aa  156  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2887  50S ribosomal protein L19  66.96 
 
 		 115 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00407134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3225  50S ribosomal protein L19  66.38 
 
 		 115 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.639554  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3001  50S ribosomal protein L19  66.96 
 
 		 115 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3361  50S ribosomal protein L19  66.38 
 
 		 115 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.407849  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2889  50S ribosomal protein L19  66.96 
 
 		 115 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.317443  normal  0.332648 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2868  50S ribosomal protein L19  66.96 
 
 		 115 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0111282 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0879  50S ribosomal protein L19  66.38 
 
 		 115 aa  156  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2818  50S ribosomal protein L19  66.96 
 
 		 115 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241725  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  66.96 
 
 		 131 aa  156  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  64.1 
 
 		 114 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  64.1 
 
 		 114 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  66.09 
 
 		 115 aa  154  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  66.09 
 
 		 115 aa  154  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>