More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1446 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  62 
 
 
520 aa  639  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.71 
 
 
533 aa  639  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0322  EmrB/QacA family drug resistance transporter  75.05 
 
 
522 aa  748  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.516199 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.73 
 
 
519 aa  644  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.53 
 
 
519 aa  640  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  66 
 
 
518 aa  662  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  69.51 
 
 
544 aa  697  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.01 
 
 
519 aa  639  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.62 
 
 
537 aa  641  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.01 
 
 
519 aa  635  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0707168 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.53 
 
 
519 aa  642  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  73.6 
 
 
527 aa  776  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  62.43 
 
 
519 aa  640  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  90.94 
 
 
522 aa  902  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201721  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.53 
 
 
519 aa  640  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.73 
 
 
519 aa  644  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.53 
 
 
519 aa  641  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
524 aa  1034  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  73.52 
 
 
520 aa  761  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  66.2 
 
 
518 aa  666  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  77.48 
 
 
522 aa  746  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  62.43 
 
 
519 aa  639  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  66.4 
 
 
518 aa  679  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  62.43 
 
 
519 aa  639  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.73 
 
 
519 aa  644  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.73 
 
 
519 aa  644  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  77.28 
 
 
522 aa  743  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.6 
 
 
519 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0184869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1385  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.6 
 
 
519 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.72 
 
 
521 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1635  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  61.6 
 
 
520 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296627  decreased coverage  0.000294236 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  59.36 
 
 
519 aa  602  1e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.91 
 
 
520 aa  575  1e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2415  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.3 
 
 
517 aa  573  1e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0858  EmrB/QacA family drug resistance transporter  59.24 
 
 
515 aa  562  1e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916368  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.34 
 
 
517 aa  564  1e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.52 
 
 
577 aa  561  1e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440847  normal  0.0484708 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2022  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.62 
 
 
520 aa  564  1e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00497968 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7509  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.79 
 
 
517 aa  563  1e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5791  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.71 
 
 
517 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0859755  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.91 
 
 
518 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1129  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  54.45 
 
 
525 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943729  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4472  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.29 
 
 
519 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238318  normal  0.949404 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.04 
 
 
543 aa  547  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.93 
 
 
520 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  7.22288e-05  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4010  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.89 
 
 
519 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  53.94 
 
 
511 aa  538  1e-152  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  53.94 
 
 
511 aa  538  1e-152  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.94 
 
 
511 aa  538  1e-152  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.73 
 
 
511 aa  536  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.24 
 
 
519 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196393  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5722  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.24 
 
 
519 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102537  normal  0.245407 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4583  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.24 
 
 
519 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169299  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  53.41 
 
 
531 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.93 
 
 
521 aa  530  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.477871  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.3 
 
 
520 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.5 
 
 
520 aa  524  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.3 
 
 
520 aa  525  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.5 
 
 
520 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.1 
 
 
520 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.92 
 
 
511 aa  523  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.3 
 
 
520 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.3 
 
 
520 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  52.21 
 
 
512 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.83 
 
 
520 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  52.41 
 
 
512 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.83 
 
 
520 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.41 
 
 
515 aa  521  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.83 
 
 
520 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.83 
 
 
520 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.36 
 
 
520 aa  519  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  52.21 
 
 
512 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  52.41 
 
 
512 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.83 
 
 
520 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.73 
 
 
511 aa  518  1e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  51.3 
 
 
520 aa  517  1e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.52739e-05  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.76 
 
 
510 aa  514  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  52.32 
 
 
512 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.32 
 
 
512 aa  509  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  52.32 
 
 
512 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  52.32 
 
 
512 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.4 
 
 
519 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.3 
 
 
520 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.32 
 
 
512 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  52.32 
 
 
512 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  52.32 
 
 
512 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  52.12 
 
 
512 aa  507  1e-142  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  52.41 
 
 
512 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0252817 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3190  multidrug resistance protein B  52.21 
 
 
515 aa  496  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0313882  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0889  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.91 
 
 
513 aa  496  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5898  drug efflux transporter  51.31 
 
 
509 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.45 
 
 
494 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.7 
 
 
512 aa  466  1e-130  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  49.4 
 
 
512 aa  465  1e-130  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68140  drug efflux transporter  51.11 
 
 
509 aa  468  1e-130  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  2.79343e-05  decreased coverage  0.00567017 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2096  multidrug resistance protein  48.1 
 
 
528 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000633213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.59 
 
 
509 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.1 
 
 
527 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0372  multidrug resistance protein  48.1 
 
 
528 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00361578  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.1 
 
 
527 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>