More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1385 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4261  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  77.8 
 
 		 481 aa  715    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1223  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  70.98 
 
 		 474 aa  635    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2887  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  76.77 
 
 		 468 aa  694    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3287  microcin-processing peptidase 1  87.61 
 
 		 476 aa  841    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  80.31 
 
 		 456 aa  767    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2323  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  79.31 
 
 		 469 aa  743    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118827  normal  0.680287 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2836  PmbA protein  72.57 
 
 		 455 aa  665    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0971  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  79.4 
 
 		 469 aa  748    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0235752  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1385  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 469 aa  962    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000808939  normal  0.0131442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2079  microcin-processing peptidase 1  79.38 
 
 		 485 aa  730    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1053  microcin-processing peptidase 1  79.4 
 
 		 486 aa  749    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0887  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  63.74 
 
 		 457 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0816  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  63.74 
 
 		 457 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2570  microcin-processing peptidase 1  64.24 
 
 		 455 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1040  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  63.51 
 
 		 456 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0602  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  63.51 
 
 		 456 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1081  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  63.51 
 
 		 456 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4195  microcin-processing peptidase 1  63.51 
 
 		 456 aa  548  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0945  putative PMBA protein (tlde protein)  64.86 
 
 		 457 aa  544  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0171463 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0911  microcin-processing peptidase 1  63.98 
 
 		 460 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0527  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  60.94 
 
 		 448 aa  543  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0781  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  62.25 
 
 		 456 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0539475 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0961  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  62.84 
 
 		 456 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1019  microcin-processing peptidase 1  61.49 
 
 		 456 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.946133 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2222  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  62.61 
 
 		 470 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0957  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  62.84 
 
 		 456 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0389  pmbA protein  62.39 
 
 		 456 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2532  pmbA protein  62.39 
 
 		 456 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2954  pmbA protein  62.39 
 
 		 456 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0905  pmbA protein  62.39 
 
 		 456 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0242  pmbA protein  62.39 
 
 		 456 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1274  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.94 
 
 		 448 aa  539  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.277535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2904  TldD/PmbA family protein  62.39 
 
 		 456 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2844  TldD/PmbA family protein  62.39 
 
 		 456 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1673  pmbA protein  62.16 
 
 		 498 aa  537  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.463741  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2965  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.81 
 
 		 456 aa  537  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194502  normal  0.400947 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  57.4 
 
 		 447 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  57.3 
 
 		 446 aa  492  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  57.37 
 
 		 448 aa  492  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2415  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  56.7 
 
 		 452 aa  483  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  53.46 
 
 		 432 aa  443  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  51.03 
 
 		 452 aa  440  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  50.34 
 
 		 444 aa  433  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0847  microcin-processing peptidase 1  50.23 
 
 		 448 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273419  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4463  pmbA protein  49.77 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0853906  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4154  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  49.77 
 
 		 448 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0982  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  48.17 
 
 		 448 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0942  pmbA protein  47.07 
 
 		 452 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0949  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  48.4 
 
 		 448 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438811  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1735  hypothetical protein  48.85 
 
 		 452 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1735  hypothetical protein  48.62 
 
 		 452 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  50.8 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01893  PmbA  49.77 
 
 		 455 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0865  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  50.23 
 
 		 448 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.619374  normal  0.968432 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  51.72 
 
 		 448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2133  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  48.51 
 
 		 448 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  51.72 
 
 		 448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1132  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  47.03 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0798905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4273  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.72 
 
 		 448 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.296435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12740  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  50.23 
 
 		 448 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0474  PmbA protein  47.95 
 
 		 455 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.184246  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.21 
 
 		 457 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3740  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.73 
 
 		 460 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0414  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.95 
 
 		 455 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.273882  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5086  putative modulator of DNA gyrase  50.58 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  48.51 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0482  PmbA protein  48.97 
 
 		 453 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  47.29 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  47.17 
 
 		 446 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58050  PmbA protein  49.89 
 
 		 449 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0170866  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  47.06 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.83 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  46.61 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4551  pmbA protein  48.28 
 
 		 453 aa  391  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  47.06 
 
 		 450 aa  391  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0275  peptidase PmbA  47.39 
 
 		 446 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  46.61 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  46.61 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  47.06 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  48.05 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  46.61 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3721  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  45.67 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000190523  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  47.29 
 
 		 446 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  46.61 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  46.38 
 
 		 446 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  46.61 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4720  peptidase PmbA  46.38 
 
 		 446 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0572  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  47.72 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  46.61 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  45.8 
 
 		 450 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00273  pmbA protein  46.58 
 
 		 443 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  46.68 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  47.95 
 
 		 447 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.95 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4388  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.77 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2232  microcin-processing peptidase 1  47.62 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.352601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3663  peptidase PmbA  46.26 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4078  pmba protein  47.15 
 
 		 447 aa  378  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3805  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.47 
 
 		 461 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3631  microcin-processing peptidase 1  47.15 
 
 		 447 aa  378  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>