290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1360 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  564  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3621  hypothetical protein  82.09 
 
 
319 aa  427  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3027  DMT family permease  57.35 
 
 
303 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3336  hypothetical protein  55.59 
 
 
325 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547457  normal  0.396992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.71 
 
 
318 aa  257  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1421  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.91 
 
 
303 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0940  integral membrane protein  42.14 
 
 
314 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1657  hypothetical protein  43.23 
 
 
307 aa  215  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.907387  normal  0.515253 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7072  hypothetical protein  43.48 
 
 
304 aa  179  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6123  hypothetical protein  40.59 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  33.7 
 
 
295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4504  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.43 
 
 
348 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  33.7 
 
 
295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.7 
 
 
300 aa  104  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  31.23 
 
 
298 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  30.86 
 
 
289 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  32.4 
 
 
319 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.27 
 
 
302 aa  99.8  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.78 
 
 
301 aa  99.8  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  29.86 
 
 
303 aa  99  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  31.07 
 
 
303 aa  99  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  31.07 
 
 
303 aa  99  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  31.07 
 
 
303 aa  99  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  31.5 
 
 
301 aa  99  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  31.07 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  30.47 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  30.36 
 
 
301 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  31.58 
 
 
293 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  31.07 
 
 
303 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 
283 aa  95.9  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  29.64 
 
 
301 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.36 
 
 
313 aa  95.9  8e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  30.47 
 
 
303 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  29.82 
 
 
288 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  29.82 
 
 
288 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.89 
 
 
304 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.8 
 
 
304 aa  92.4  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.42 
 
 
304 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  34.86 
 
 
299 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  30.94 
 
 
294 aa  91.7  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.02 
 
 
297 aa  90.1  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.97 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36520  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  36.62 
 
 
336 aa  89.7  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.516696  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  33.33 
 
 
304 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  31.85 
 
 
294 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  34.53 
 
 
309 aa  87  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.06 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  29.64 
 
 
290 aa  85.5  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  31.87 
 
 
292 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0053  hypothetical protein  31.49 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.261978 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  30.04 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  27.18 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  31.25 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.77 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  28.52 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3937  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.78 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000721234  decreased coverage  0.000464529 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  26.69 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.56 
 
 
289 aa  79  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.64 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  26.07 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  26.99 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.71 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  30.11 
 
 
298 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  28.73 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  25.17 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  27.59 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.39 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  26.91 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.05 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0994  hypothetical protein  30.85 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.46 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.78 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.78 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03280  predicted permease, DMT superfamily  30.58 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  29.12 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001539  permease  29.27 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  26.32 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  24.8 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0298  hypothetical protein  30.22 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  26.88 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  25.9 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  25.36 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  30.45 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  27.08 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.33 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266368  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1261  hypothetical protein  25.68 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.647772  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  28.57 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  27.08 
 
 
358 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  25.72 
 
 
292 aa  67  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  29.85 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  26.43 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  28.06 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>