More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1359 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  50.06 
 
 
853 aa  756    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  50.06 
 
 
853 aa  756    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1181  DNA mismatch repair protein MutS  63.69 
 
 
886 aa  1040    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01536  DNA mismatch repair protein MutS  49.48 
 
 
851 aa  755    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  50.57 
 
 
857 aa  768    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  49.08 
 
 
859 aa  767    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2842  DNA mismatch repair protein MutS  67.67 
 
 
870 aa  1094    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147304  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  50.34 
 
 
880 aa  764    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  51.56 
 
 
854 aa  788    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  48.27 
 
 
856 aa  744    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1151  DNA mismatch repair protein MutS  56.85 
 
 
882 aa  895    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75556  normal  0.534383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  51.56 
 
 
855 aa  781    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  47.53 
 
 
872 aa  731    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  57.37 
 
 
939 aa  928    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  48.83 
 
 
856 aa  756    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  48.95 
 
 
856 aa  754    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  49.83 
 
 
855 aa  757    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  49.6 
 
 
851 aa  769    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  50.57 
 
 
857 aa  769    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  50.06 
 
 
853 aa  756    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  57.37 
 
 
891 aa  929    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  47.8 
 
 
846 aa  748    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  48.02 
 
 
846 aa  753    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  49.65 
 
 
859 aa  759    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  49.13 
 
 
855 aa  750    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  56.24 
 
 
860 aa  894    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  57.4 
 
 
922 aa  914    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1359  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
870 aa  1771    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  0.0149931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0993  DNA mismatch repair protein MutS  58.17 
 
 
882 aa  905    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0273389  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  53.21 
 
 
850 aa  802    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4552  DNA mismatch repair protein MutS  71 
 
 
871 aa  1204    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  48.83 
 
 
856 aa  756    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  57.55 
 
 
938 aa  930    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  51.04 
 
 
863 aa  795    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  50.75 
 
 
860 aa  775    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1166  DNA mismatch repair protein MutS  49.83 
 
 
863 aa  774    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  49.71 
 
 
855 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5394  DNA mismatch repair protein MutS  58.08 
 
 
885 aa  896    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.597717  normal  0.74748 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1657  DNA mismatch repair protein MutS  50.92 
 
 
868 aa  746    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1186  DNA mismatch repair protein MutS  57.24 
 
 
884 aa  887    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296401 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  42.82 
 
 
872 aa  636    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  49.54 
 
 
851 aa  768    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  48.12 
 
 
871 aa  770    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  49.42 
 
 
871 aa  774    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  47.13 
 
 
874 aa  764    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  52.14 
 
 
902 aa  859    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2107  DNA mismatch repair protein MutS  58.05 
 
 
885 aa  898    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.069343 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1238  DNA mismatch repair protein MutS  50.4 
 
 
858 aa  736    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  57.52 
 
 
893 aa  928    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  57.26 
 
 
939 aa  926    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2520  DNA mismatch repair protein MutS  57.24 
 
 
894 aa  890    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00821283  hitchhiker  0.000000391787 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  57.26 
 
 
891 aa  922    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  49.48 
 
 
851 aa  767    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2052  DNA mismatch repair protein MutS  72.09 
 
 
890 aa  1204    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.292542  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  50.46 
 
 
857 aa  775    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1832  DNA mismatch repair protein MutS  74.71 
 
 
882 aa  1292    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  47.6 
 
 
887 aa  758    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  48.48 
 
 
856 aa  754    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  53.5 
 
 
884 aa  863    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  53.5 
 
 
884 aa  863    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3337  DNA mismatch repair protein MutS  87.56 
 
 
864 aa  1522    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1617  DNA mismatch repair protein MutS  57.13 
 
 
878 aa  880    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  49.88 
 
 
862 aa  773    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  49.94 
 
 
858 aa  764    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1399  DNA mismatch repair protein MutS  57.05 
 
 
892 aa  876    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  49.6 
 
 
859 aa  759    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  49.3 
 
 
853 aa  756    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  49.77 
 
 
862 aa  778    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1075  DNA mismatch repair protein MutS  58.48 
 
 
916 aa  944    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835373  normal  0.410772 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0209  DNA mismatch repair protein MutS  46.14 
 
 
855 aa  706    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  49.6 
 
 
851 aa  769    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2274  DNA mismatch repair protein MutS  70.13 
 
 
911 aa  1224    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.103313 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  57.37 
 
 
939 aa  928    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5989  DNA mismatch repair protein MutS  57.45 
 
 
885 aa  911    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  48.6 
 
 
854 aa  748    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  46.93 
 
 
889 aa  711    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  49.24 
 
 
856 aa  756    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  49.71 
 
 
855 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  49.02 
 
 
859 aa  764    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  50 
 
 
860 aa  758    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  47.62 
 
 
856 aa  753    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  57.37 
 
 
939 aa  928    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  48.9 
 
 
861 aa  760    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  49.08 
 
 
861 aa  758    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  51.62 
 
 
878 aa  783    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  49.36 
 
 
861 aa  758    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  49.25 
 
 
853 aa  760    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  57.66 
 
 
886 aa  912    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  51.56 
 
 
855 aa  781    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  49.94 
 
 
853 aa  758    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  49.94 
 
 
853 aa  754    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  48.96 
 
 
858 aa  770    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  45.68 
 
 
883 aa  743    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2088  DNA mismatch repair protein MutS  57.45 
 
 
885 aa  896    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1998  DNA mismatch repair protein MutS  57.66 
 
 
885 aa  910    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000368418 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  50.06 
 
 
853 aa  756    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  43.64 
 
 
868 aa  643    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  49.31 
 
 
861 aa  761    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  42.56 
 
 
870 aa  635    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  49.3 
 
 
859 aa  775    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>