More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1290 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  92.31 
 
 		 234 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  87.18 
 
 		 234 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  86.32 
 
 		 234 aa  374  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  82.48 
 
 		 234 aa  350  8.999999999999999e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  63.04 
 
 		 233 aa  288  5.0000000000000004e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  56.41 
 
 		 234 aa  247  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  58.04 
 
 		 234 aa  245  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  56.41 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  56.62 
 
 		 234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  56.62 
 
 		 234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  56.62 
 
 		 234 aa  234  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  55.9 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.55 
 
 		 235 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.55 
 
 		 235 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  53.04 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  53.04 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  53.04 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  53.04 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  53.04 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  53.04 
 
 		 237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  52.17 
 
 		 234 aa  211  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  53.3 
 
 		 332 aa  206  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  48.86 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  48.43 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.42 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.86 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  51.61 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.87 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.86 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  47.09 
 
 		 231 aa  174  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  47.37 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  47.84 
 
 		 241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  46.9 
 
 		 228 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  46.9 
 
 		 228 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  44.04 
 
 		 256 aa  171  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  39.47 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  42.15 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  41.7 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.3 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 245 aa  151  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.29 
 
 		 237 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.29 
 
 		 237 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  43.78 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  42.86 
 
 		 239 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  40.72 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.4 
 
 		 247 aa  132  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 		 265 aa  128  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  38.17 
 
 		 243 aa  125  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  34.51 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  37.95 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.75 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 244 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 		 270 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.7 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  37.89 
 
 		 304 aa  97.4  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 293 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 251 aa  95.5  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.315729  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 		 314 aa  95.5  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  35 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 		 317 aa  94.4  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  34.44 
 
 		 283 aa  92.4  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 		 270 aa  92.4  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 		 338 aa  92  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 		 290 aa  91.7  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  32.49 
 
 		 284 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 		 272 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  29.77 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 251 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 271 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1505  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.64 
 
 		 244 aa  89.4  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0160485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 		 272 aa  89  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.24 
 
 		 273 aa  88.6  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  34.74 
 
 		 286 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  29.78 
 
 		 417 aa  88.2  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.77 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03276  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G14460)  35.75 
 
 		 279 aa  86.3  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0176594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 		 268 aa  86.3  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.898611  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 284 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 284 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 284 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.92 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.2 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 		 285 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 		 267 aa  85.9  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  34.44 
 
 		 280 aa  85.9  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>