More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1178 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 
174 aa  353  6.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3188  hexapaptide repeat-containing transferase  77.46 
 
 
174 aa  287  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798925  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  74.14 
 
 
174 aa  270  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  74.14 
 
 
174 aa  269  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0908  transferase hexapeptide protein  73.56 
 
 
174 aa  265  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  68.39 
 
 
174 aa  254  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2653  transferase hexapeptide protein  69.54 
 
 
174 aa  251  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1720  hexapaptide repeat-containing transferase  67.82 
 
 
174 aa  231  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1577  hexapaptide repeat-containing transferase  60.92 
 
 
174 aa  228  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447375  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  60.92 
 
 
174 aa  226  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0365  hexapaptide repeat-containing transferase  64.67 
 
 
174 aa  226  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  60.34 
 
 
174 aa  225  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  60.12 
 
 
174 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  65.52 
 
 
174 aa  224  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  59.2 
 
 
174 aa  224  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1435  hexapaptide repeat-containing transferase  60.34 
 
 
174 aa  224  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893089  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  58.62 
 
 
174 aa  221  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  58.62 
 
 
174 aa  220  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  57.47 
 
 
174 aa  220  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  57.47 
 
 
174 aa  220  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  58.62 
 
 
174 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  58.62 
 
 
174 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4821  hexapaptide repeat-containing transferase  56.9 
 
 
261 aa  217  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849886  normal  0.480457 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1852  hexapaptide repeat-containing transferase  61.85 
 
 
174 aa  216  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  58.05 
 
 
174 aa  214  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1073  hexapaptide repeat-containing transferase  57.14 
 
 
176 aa  212  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.099583  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1898  hexapeptide repeat-containing transferase  58.05 
 
 
174 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2480  putative acetyltransferase  61.18 
 
 
178 aa  211  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00330566  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2573  hexapeptide repeat-containing transferase  56.9 
 
 
174 aa  209  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2627  hexapeptide repeat-containing transferase  56.9 
 
 
174 aa  209  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1265  hexapaptide repeat-containing transferase  54.91 
 
 
173 aa  209  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301445  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  57.8 
 
 
173 aa  208  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2707  hexapeptide repeat-containing transferase  56.32 
 
 
192 aa  208  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2083  putative acetyltransferase  60.47 
 
 
180 aa  207  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185371  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2189  hexapeptide repeat-containing transferase  56.32 
 
 
174 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1686  hexapeptide repeat-containing transferase  56.32 
 
 
174 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0376893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1462  hexapeptide repeat-containing transferase  56.32 
 
 
174 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3129  hexapeptide repeat-containing transferase  56.32 
 
 
174 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.316555  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2634  hexapaptide repeat-containing transferase  55.43 
 
 
176 aa  206  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.988857  normal  0.429505 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2575  carbonic anhydrase  55.11 
 
 
176 aa  205  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  56.73 
 
 
172 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  56.07 
 
 
175 aa  204  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  56.73 
 
 
172 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  57.8 
 
 
175 aa  203  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0468  hexapaptide repeat-containing transferase  53.71 
 
 
177 aa  202  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1454  anhydrase family 3 protein  55.09 
 
 
174 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  54.91 
 
 
174 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4267  hexapaptide repeat-containing transferase  53.89 
 
 
174 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3654  hexapaptide repeat-containing transferase  53.71 
 
 
177 aa  201  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443395  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0976  transferase hexapeptide repeat containing protein  57.8 
 
 
175 aa  201  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11932  normal  0.0642131 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1105  carbonic anhydrase  54.97 
 
 
172 aa  201  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.519901  normal  0.0228348 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1072  hypothetical protein  57.8 
 
 
175 aa  200  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0856829  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15870  hypothetical protein  55.69 
 
 
174 aa  200  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0689181 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1095  hexapaptide repeat-containing transferase  56.07 
 
 
174 aa  200  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2439  transferase hexapeptide protein  55.56 
 
 
172 aa  199  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020264 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1556  transferase hexapeptide repeat containing protein  65.79 
 
 
173 aa  199  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3742  transferase family protein  53.45 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0368075  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1635  transferase hexapeptide repeat containing protein  51.43 
 
 
177 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1059  transferase family protein  53.89 
 
 
174 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4925  hexapaptide repeat-containing transferase  52.6 
 
 
174 aa  198  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  53.49 
 
 
174 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1365  hypothetical protein  54.49 
 
 
174 aa  197  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1667  hypothetical protein  53.18 
 
 
184 aa  197  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  53.89 
 
 
174 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  52.87 
 
 
194 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1693  hexapaptide repeat-containing transferase  53.14 
 
 
176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.529544  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  55.75 
 
 
174 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  54.91 
 
 
174 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3408  carbonic anhydrase  54.49 
 
 
174 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50052  normal  0.517344 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01995  Carbonic anhydrases/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily protein  54.49 
 
 
174 aa  194  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000189812  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0453  hexapaptide repeat-containing transferase  54.29 
 
 
176 aa  194  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155636  normal  0.104163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4165  transferase family protein  52.69 
 
 
174 aa  194  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.210704 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0836  carbonic anhydrase  53.18 
 
 
178 aa  193  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.871401 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1530  gamma-class carbonic anhydrase family protein  54.34 
 
 
174 aa  192  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.256343 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0832  hexapaptide repeat-containing transferase  53.18 
 
 
178 aa  191  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0076  transferase hexapeptide repeat containing protein  54.07 
 
 
175 aa  192  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2190  hypothetical protein  51.19 
 
 
181 aa  191  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0134235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2042  hexapaptide repeat-containing transferase  55.19 
 
 
175 aa  191  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1933  ferripyochelin-binding protein  47.98 
 
 
175 aa  191  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  54.02 
 
 
174 aa  191  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0817  transferase  51.45 
 
 
178 aa  189  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3140  hypothetical protein  50.57 
 
 
176 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.735648  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2224  transferase family protein  52.66 
 
 
173 aa  188  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.076272  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1465  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  53.29 
 
 
174 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2139  hexapaptide repeat-containing transferase  50.57 
 
 
176 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328816  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1326  hypothetical protein  52.6 
 
 
177 aa  187  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal  0.329427 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2377  transferase hexapeptide repeat containing protein  48.86 
 
 
176 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3284  hexapaptide repeat-containing transferase  49.43 
 
 
176 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.619416  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2172  carbonic anhydrase  49.43 
 
 
176 aa  186  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.441175  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5226  hypothetical protein  49.43 
 
 
176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592347  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1274  hexapaptide repeat-containing transferase  54.55 
 
 
174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3912  hypothetical protein  49.43 
 
 
176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1221  putative ferripyochelin-binding protein  46.82 
 
 
175 aa  182  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1260  ferripyochelin-binding protein, putative  46.82 
 
 
175 aa  182  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164066  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2053  hexapaptide repeat-containing transferase  49.12 
 
 
173 aa  182  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2096  hypothetical protein  47.09 
 
 
173 aa  182  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2707  acetyltransferase protein  47.43 
 
 
176 aa  181  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1727  ferripyochelin binding protein-like  51.45 
 
 
177 aa  180  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  51.28 
 
 
170 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3937  transferase hexapeptide protein  48.26 
 
 
175 aa  177  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>