More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1168 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  63.62 
 
 		 647 aa  731    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  64.53 
 
 		 609 aa  763    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 616 aa  1236    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  64.86 
 
 		 609 aa  766    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.4 
 
 		 614 aa  596  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  49.43 
 
 		 620 aa  543  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  46.63 
 
 		 645 aa  533  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  47.66 
 
 		 605 aa  519  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  44.87 
 
 		 663 aa  515  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  45.42 
 
 		 602 aa  502  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  45.81 
 
 		 601 aa  501  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  48.83 
 
 		 602 aa  497  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  44.07 
 
 		 509 aa  406  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  43.47 
 
 		 612 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 		 592 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.86 
 
 		 610 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 		 633 aa  324  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  34.99 
 
 		 603 aa  324  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  33.76 
 
 		 607 aa  318  2e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  35.35 
 
 		 612 aa  317  3e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 603 aa  316  8e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 610 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  33.28 
 
 		 610 aa  310  6.999999999999999e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  34.53 
 
 		 610 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.25 
 
 		 610 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 		 603 aa  301  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.22 
 
 		 601 aa  299  9e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  32.79 
 
 		 597 aa  296  9e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 		 599 aa  293  5e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  32.61 
 
 		 601 aa  293  8e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  32.61 
 
 		 601 aa  293  8e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 		 609 aa  292  9e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  32.61 
 
 		 588 aa  292  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 601 aa  288  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 602 aa  287  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  32.18 
 
 		 611 aa  286  5.999999999999999e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  32.26 
 
 		 601 aa  286  7e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 		 605 aa  285  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  33.28 
 
 		 580 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  33.28 
 
 		 580 aa  284  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 		 660 aa  281  3e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  33.83 
 
 		 597 aa  280  6e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  31.39 
 
 		 601 aa  280  8e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  31.43 
 
 		 669 aa  278  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  30.78 
 
 		 602 aa  278  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 597 aa  277  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 		 591 aa  277  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.73 
 
 		 602 aa  276  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  33.16 
 
 		 597 aa  276  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  33.16 
 
 		 597 aa  276  7e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  32.12 
 
 		 598 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.1 
 
 		 597 aa  274  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  30.76 
 
 		 605 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  30.15 
 
 		 594 aa  273  8.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 601 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 601 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 601 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 		 597 aa  270  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 601 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 598 aa  270  7e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  34.07 
 
 		 604 aa  270  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 604 aa  269  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 		 598 aa  269  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 		 601 aa  269  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  33.55 
 
 		 607 aa  269  1e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 		 604 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 		 605 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  32.47 
 
 		 568 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  31.15 
 
 		 652 aa  267  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 		 597 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 		 622 aa  265  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  29.44 
 
 		 637 aa  264  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 		 660 aa  264  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 		 597 aa  264  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 		 602 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 		 602 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  30.52 
 
 		 618 aa  263  6.999999999999999e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  33.69 
 
 		 599 aa  263  8.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  32.62 
 
 		 602 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 590 aa  262  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 		 600 aa  261  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54151  long chain acyl-CoA synthetase  30.43 
 
 		 702 aa  261  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 		 597 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 		 597 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  31.16 
 
 		 601 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  31.97 
 
 		 616 aa  259  7e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 		 672 aa  259  8e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 630 aa  259  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  32.6 
 
 		 597 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  30.56 
 
 		 587 aa  258  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 599 aa  257  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  32.79 
 
 		 612 aa  257  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 606 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  33.28 
 
 		 606 aa  256  7e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 		 622 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 		 606 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 		 606 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 595 aa  255  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 		 604 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 		 600 aa  255  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>