More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1154 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1154  ABC transporter related  100 
 
 		 215 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.496221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3214  ABC transporter related  82.94 
 
 		 214 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  77.46 
 
 		 217 aa  324  7e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3469  ABC transporter related  74.77 
 
 		 216 aa  315  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  76.78 
 
 		 225 aa  309  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1293  ABC transporter-related protein  75.47 
 
 		 235 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186144  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3112  ABC transporter related  75.83 
 
 		 225 aa  288  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2035  ABC transporter, ATP-binding protein  71.09 
 
 		 219 aa  276  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.522762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5154  ABC transporter related  67.58 
 
 		 238 aa  275  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.792432 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1284  ABC transporter-related protein  63.26 
 
 		 231 aa  238  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000136369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5007  ABC transporter related  60.56 
 
 		 243 aa  231  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.283517  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1640  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit  59.15 
 
 		 245 aa  226  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2156  ABC transporter related  60.59 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.506853  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  59.33 
 
 		 238 aa  221  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0895  ABC transporter related  55.35 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.323995  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  51.43 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  51.15 
 
 		 224 aa  194  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0805  ABC transporter related  51.15 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  47.25 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  51.04 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  51.04 
 
 		 229 aa  184  6e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  48.15 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  51.5 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  48.56 
 
 		 246 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  46.92 
 
 		 243 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  52.5 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  51.98 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  52 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  52.66 
 
 		 242 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  48.74 
 
 		 239 aa  179  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  52.5 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  48.8 
 
 		 305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  44.6 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  45.93 
 
 		 279 aa  178  4e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  43.93 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  47.51 
 
 		 272 aa  178  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  52 
 
 		 227 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 		 238 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0836  peptide ABC transporter ATPase  44.5 
 
 		 251 aa  177  9e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.506405  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0086  ABC transporter, ATP-binding protein  48.33 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0084  ABC transporter, ATP-binding protein  48.33 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.78 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  45.41 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  45.63 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  44.39 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  51.49 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  49.22 
 
 		 240 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  48.13 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  48.13 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  48.24 
 
 		 219 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  48.13 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.26 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  45.33 
 
 		 264 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  50.24 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  49.07 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  51.49 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  51.49 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2309  ABC transporter, ATP-binding protein  51.49 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  51.49 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  48.13 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  49.74 
 
 		 263 aa  176  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  50.26 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  50.26 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.26 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.26 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  48.45 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  50.26 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.26 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  51.79 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  39.72 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.26 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  50 
 
 		 242 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  50.26 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  40.28 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  44.09 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  42.27 
 
 		 260 aa  175  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  50 
 
 		 250 aa  175  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2467  ABC transporter, ATP-binding protein  50.99 
 
 		 238 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  45.07 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  45.24 
 
 		 244 aa  175  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  47.52 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  40.87 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  48.13 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1920  ABC transporter related  52.79 
 
 		 227 aa  174  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0842487  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  50.52 
 
 		 239 aa  175  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  45.91 
 
 		 252 aa  175  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  50.98 
 
 		 224 aa  174  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1123  ABC transporter related  48.21 
 
 		 243 aa  175  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0137163  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  49.3 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1835  ABC transporter-related protein  53.06 
 
 		 227 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0817226  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  40.76 
 
 		 228 aa  174  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  47.24 
 
 		 223 aa  174  8e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 643 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1758  ABC transporter related  47.5 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.101671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>