155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1151 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  83.72 
 
 
215 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  78.97 
 
 
214 aa  354  6e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  78.6 
 
 
215 aa  350  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  78.6 
 
 
215 aa  349  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  76.74 
 
 
215 aa  346  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  76.74 
 
 
215 aa  346  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  74.42 
 
 
215 aa  338  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  66.05 
 
 
215 aa  303  1e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  65.12 
 
 
215 aa  293  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  56.74 
 
 
215 aa  254  5e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  55.81 
 
 
215 aa  249  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  56.07 
 
 
208 aa  242  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  56.07 
 
 
208 aa  238  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  53.74 
 
 
208 aa  236  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  51.4 
 
 
208 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  51.87 
 
 
208 aa  226  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  51.87 
 
 
208 aa  226  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  51.87 
 
 
208 aa  226  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  50.93 
 
 
208 aa  225  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  50.93 
 
 
208 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  4.97448e-05  hitchhiker  6.94622e-09 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  50.93 
 
 
208 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  52.8 
 
 
208 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  50.93 
 
 
208 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  50.47 
 
 
208 aa  224  8e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  50.47 
 
 
208 aa  224  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  52.34 
 
 
208 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  50 
 
 
208 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  50 
 
 
208 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  50 
 
 
208 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  50 
 
 
208 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  50 
 
 
208 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  50 
 
 
208 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  50 
 
 
208 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  50 
 
 
208 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  46.05 
 
 
212 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.12514e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  46.73 
 
 
208 aa  191  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  39.05 
 
 
205 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  38.57 
 
 
205 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.31524e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  41.23 
 
 
205 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  39.52 
 
 
205 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  38.57 
 
 
205 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  39.52 
 
 
205 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  39.34 
 
 
204 aa  145  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  35.71 
 
 
206 aa  144  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  35.81 
 
 
211 aa  140  2e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  35.35 
 
 
211 aa  140  2e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  35.35 
 
 
211 aa  138  5e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  34.11 
 
 
211 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  35.05 
 
 
213 aa  136  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  35.98 
 
 
213 aa  135  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  33.33 
 
 
219 aa  134  1e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  133  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  30.84 
 
 
214 aa  133  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  34.76 
 
 
209 aa  131  7e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  32.38 
 
 
209 aa  129  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  36.41 
 
 
209 aa  127  2e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  31.75 
 
 
207 aa  125  4e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  32.86 
 
 
209 aa  122  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  33.94 
 
 
212 aa  122  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  29.91 
 
 
209 aa  120  1e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0716  hypothetical protein  32.41 
 
 
214 aa  120  2e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  34.98 
 
 
204 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  35.51 
 
 
209 aa  116  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  33.8 
 
 
217 aa  115  4e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  33.18 
 
 
206 aa  114  8e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  31.8 
 
 
209 aa  114  1e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  33.18 
 
 
390 aa  112  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  31.6 
 
 
206 aa  110  1e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  29.86 
 
 
208 aa  109  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  5.48446e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  31.28 
 
 
206 aa  108  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  30.29 
 
 
208 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  30.7 
 
 
213 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  31.72 
 
 
211 aa  105  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  30.52 
 
 
210 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  28.84 
 
 
210 aa  105  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  29.86 
 
 
205 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  29.3 
 
 
214 aa  104  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3001  hypothetical protein  28.02 
 
 
207 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  8.63551e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  29.77 
 
 
213 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  29.86 
 
 
205 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  31.73 
 
 
208 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  31.19 
 
 
205 aa  101  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  29.63 
 
 
206 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  28.91 
 
 
205 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  32.2 
 
 
204 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2522  protein of unknown function DUF47  30.99 
 
 
214 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0386  protein of unknown function DUF47  25 
 
 
206 aa  100  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3760  putative low-affinity phosphate transport accessory protein  28.5 
 
 
214 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  29.81 
 
 
205 aa  98.6  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  28.91 
 
 
205 aa  98.2  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3162  hypothetical protein  30.37 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1747  hypothetical protein  28.05 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2818  Putitive phosphate transport regulator  33.49 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2947  hypothetical protein  28.84 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.847202  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  30.73 
 
 
205 aa  96.7  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  29.19 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  8.51308e-11 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0687  hypothetical protein  31.16 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00131316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  29.19 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  1.52766e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0702  hypothetical protein  31.16 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.82132e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>