242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0812 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0812  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1336  hypothetical protein  85.25 
 
 		 323 aa  490  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1626  hypothetical protein  67.54 
 
 		 305 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.117242  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4328  hypothetical protein  67.21 
 
 		 304 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0926  hypothetical protein  66.01 
 
 		 302 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171761 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0861  hypothetical protein  66.01 
 
 		 302 aa  394  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2029  hypothetical protein  67.21 
 
 		 302 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.978666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4159  hypothetical protein  64.59 
 
 		 305 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3582  hypothetical protein  65.91 
 
 		 303 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0102309  normal  0.126925 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2708  hypothetical protein  55.19 
 
 		 307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0708  hypothetical protein  54.07 
 
 		 302 aa  287  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736832 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  44.3 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2156  hypothetical protein  43.41 
 
 		 311 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4106  hypothetical protein  42.95 
 
 		 307 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0456946  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2097  hypothetical protein  43.59 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3050  hypothetical protein  43.59 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1585  hypothetical protein  43.27 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438079  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0958  hypothetical protein  43.27 
 
 		 307 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.430374  normal  0.462725 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0814  hypothetical protein  43.59 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.506209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2647  hypothetical protein  43.59 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2950  hypothetical protein  43.59 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.2121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3016  hypothetical protein  43.59 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.2767  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1965  hypothetical protein  43.59 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725996  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3086  hypothetical protein  42.17 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.966658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0519  hypothetical protein  43.27 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0998  hypothetical protein  43.27 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2402  hypothetical protein  42.95 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1957  hypothetical protein  42.44 
 
 		 311 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.330049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2277  hypothetical protein  42.77 
 
 		 311 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.268275  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0904  hypothetical protein  42.49 
 
 		 315 aa  235  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0870  hypothetical protein  42.95 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0858  hypothetical protein  42.95 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0668  hypothetical protein  41.53 
 
 		 319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0855  hypothetical protein  41.99 
 
 		 311 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2474  hypothetical protein  41.35 
 
 		 311 aa  225  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  42.53 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3848  hypothetical protein  42.02 
 
 		 288 aa  216  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  40.51 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0474  hypothetical protein  43.93 
 
 		 288 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1079  hypothetical protein  39.88 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  37.54 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  37.86 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  36.48 
 
 		 287 aa  165  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  36.89 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  36.81 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  36.54 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  35.83 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  37.13 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  35.83 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  36.33 
 
 		 288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  36.66 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  36.81 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  36.01 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  38.31 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  36.66 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  36.16 
 
 		 287 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  36.94 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  34.73 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  36.48 
 
 		 287 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  35.69 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  36.46 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3269  hypothetical protein  37.34 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  34.73 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02840  hypothetical protein  36.93 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  35.03 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  34.39 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  34.73 
 
 		 287 aa  155  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  36.57 
 
 		 289 aa  155  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  33.76 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02368  hypothetical protein  35.86 
 
 		 282 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  34.3 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  34.41 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  34.95 
 
 		 287 aa  153  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  39.18 
 
 		 288 aa  152  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  34.73 
 
 		 287 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  34.73 
 
 		 287 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  34.73 
 
 		 287 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  34.73 
 
 		 287 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  34.09 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1271  hypothetical protein  30.87 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00975001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  35.28 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  33.22 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  35.28 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  34.63 
 
 		 287 aa  149  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1993  hypothetical protein  34.09 
 
 		 288 aa  148  9e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3972  hypothetical protein  30.55 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00569731  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1448  hypothetical protein  38.51 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0364721  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  32.29 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0406  hypothetical protein  35.74 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.71757  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  32.59 
 
 		 291 aa  146  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3696  hypothetical protein  30.1 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3916  hypothetical protein  30.23 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  30.23 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3921  hypothetical protein  30.23 
 
 		 291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.831608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3632  hypothetical protein  30.23 
 
 		 291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  30.23 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  30.23 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4011  hypothetical protein  30.23 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1033  domain of unknown function DUF1732  31.72 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>