More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0748 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  84.45 
 
 		 379 aa  639    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  82.8 
 
 		 378 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  89.68 
 
 		 378 aa  686    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 378 aa  759    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0773  gamma-glutamyl kinase  83.16 
 
 		 380 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0844  gamma-glutamyl kinase  82.89 
 
 		 380 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.481777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3914  gamma-glutamyl kinase  82.31 
 
 		 380 aa  600  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  75.53 
 
 		 382 aa  580  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3672  gamma-glutamyl kinase  81.87 
 
 		 379 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.039065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  79.35 
 
 		 372 aa  563  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  78.05 
 
 		 372 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  70.11 
 
 		 372 aa  518  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  71.47 
 
 		 372 aa  508  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  67.12 
 
 		 372 aa  504  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  71.74 
 
 		 372 aa  507  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  70.92 
 
 		 372 aa  501  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  71.2 
 
 		 372 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  71.35 
 
 		 374 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  70.65 
 
 		 372 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  71.35 
 
 		 374 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  71.2 
 
 		 372 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  70.65 
 
 		 372 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  70.65 
 
 		 372 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  70.65 
 
 		 372 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  70.65 
 
 		 372 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  70.65 
 
 		 372 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  70.38 
 
 		 372 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  66.94 
 
 		 372 aa  495  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  70.38 
 
 		 372 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  70.38 
 
 		 372 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  70.38 
 
 		 372 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  70.38 
 
 		 372 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  70.38 
 
 		 394 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  70.11 
 
 		 372 aa  494  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  70.38 
 
 		 372 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  71.2 
 
 		 374 aa  488  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  66.13 
 
 		 374 aa  484  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  65.49 
 
 		 372 aa  479  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  64.21 
 
 		 371 aa  472  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  58.15 
 
 		 374 aa  432  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  58.15 
 
 		 390 aa  428  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  58.79 
 
 		 368 aa  418  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  58.31 
 
 		 375 aa  415  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  59.13 
 
 		 378 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  58.24 
 
 		 372 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  58.24 
 
 		 372 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  55.01 
 
 		 376 aa  411  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  53.93 
 
 		 376 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  59.07 
 
 		 372 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  55.59 
 
 		 375 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  59.07 
 
 		 373 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  58.79 
 
 		 372 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  58.79 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  57.42 
 
 		 372 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0858  gamma-glutamyl kinase  58.58 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0105345  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  57.42 
 
 		 372 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  57.42 
 
 		 372 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  57.14 
 
 		 372 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  53.33 
 
 		 376 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  53.53 
 
 		 373 aa  388  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  53.26 
 
 		 376 aa  386  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  53.26 
 
 		 376 aa  386  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0848  gamma-glutamyl kinase  57.34 
 
 		 380 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  54.4 
 
 		 374 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0197  glutamate 5-kinase  66.67 
 
 		 260 aa  338  8e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.670063  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0215  glutamate 5-kinase  66.8 
 
 		 260 aa  338  9.999999999999999e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.256743 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1600  gamma-glutamyl kinase  50 
 
 		 405 aa  334  1e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0157762  hitchhiker  0.000100305 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  48.5 
 
 		 373 aa  331  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  49.18 
 
 		 376 aa  331  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  47.01 
 
 		 390 aa  328  8e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  47.83 
 
 		 373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1503  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 		 390 aa  323  3e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1682  gamma-glutamyl kinase  50.14 
 
 		 390 aa  323  3e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  47.33 
 
 		 387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  47.03 
 
 		 373 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1783  glutamate 5-kinase  50.8 
 
 		 383 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00674296  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1460  glutamate 5-kinase  50.8 
 
 		 399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  48.77 
 
 		 374 aa  308  6.999999999999999e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  43.53 
 
 		 373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  46.96 
 
 		 372 aa  306  6e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  46.05 
 
 		 378 aa  303  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  46.05 
 
 		 367 aa  301  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  47.01 
 
 		 373 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  47.68 
 
 		 367 aa  299  7e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  44.05 
 
 		 379 aa  297  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  47.9 
 
 		 373 aa  296  6e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  47.03 
 
 		 385 aa  295  7e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  46.7 
 
 		 376 aa  294  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  45.16 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  46.41 
 
 		 393 aa  293  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  47.62 
 
 		 373 aa  293  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  43.6 
 
 		 392 aa  292  6e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  44.32 
 
 		 370 aa  292  8e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  47.14 
 
 		 369 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  45.93 
 
 		 366 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  42.35 
 
 		 373 aa  290  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  46.58 
 
 		 375 aa  290  4e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  45.33 
 
 		 377 aa  289  5.0000000000000004e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  42.35 
 
 		 373 aa  288  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  44.62 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>