23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0742 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0553  Patatin  53.32 
 
 		 828 aa  854    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2089  patatin  65.7 
 
 		 830 aa  1101    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0919743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0742  patatin  100 
 
 		 816 aa  1660    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.885952  normal  0.0715613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25380  Patatin-like phospholipase  63.68 
 
 		 825 aa  1055    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.969394  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1083  patatin  35.32 
 
 		 818 aa  477  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4091  patatin  31.95 
 
 		 774 aa  347  5e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0030  patatin  31.86 
 
 		 770 aa  332  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.491773  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2051  hypothetical protein  38.38 
 
 		 773 aa  268  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475949  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3407  patatin-related protein  26.01 
 
 		 818 aa  172  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2615  patatin  26.81 
 
 		 926 aa  171  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0888746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1602  Patatin  26.1 
 
 		 1137 aa  159  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0045  Patatin  27.21 
 
 		 1107 aa  141  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.604758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1052  patatin  29.62 
 
 		 1171 aa  140  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3961  Patatin  24.18 
 
 		 1056 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1675  patatin family phospholipase  25.99 
 
 		 1153 aa  98.2  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5555  patatin  25.79 
 
 		 954 aa  86.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2668  hypothetical protein  26.47 
 
 		 978 aa  81.6  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1147  patatin-related protein  28.17 
 
 		 818 aa  77  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0770474  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5159  Patatin  26.29 
 
 		 1320 aa  68.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51871  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7272  patatin  29.25 
 
 		 1101 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.341762  normal  0.239541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2776  Patatin  24.52 
 
 		 1383 aa  61.6  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0052  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1142 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13514  hypothetical protein  36.21 
 
 		 1031 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.577448 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>