130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0725 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 334 aa  678    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  54.7 
 
 		 315 aa  328  6e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  54.7 
 
 		 315 aa  328  6e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  52.33 
 
 		 298 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  49.01 
 
 		 342 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  45.39 
 
 		 312 aa  269  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  46.18 
 
 		 342 aa  260  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  45.92 
 
 		 313 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  45.92 
 
 		 307 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  45.36 
 
 		 307 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  43.6 
 
 		 325 aa  249  6e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  44.29 
 
 		 309 aa  248  9e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  40.28 
 
 		 597 aa  219  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  38.41 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  31.82 
 
 		 314 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  30.07 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  30.08 
 
 		 327 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  28.26 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 346 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  29.97 
 
 		 321 aa  95.9  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  30.28 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  29.82 
 
 		 310 aa  94  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  27.3 
 
 		 364 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  29.01 
 
 		 333 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  29.36 
 
 		 310 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  31.84 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  27.38 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  23.82 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  28.95 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  31.08 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 		 351 aa  86.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  27.85 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  29.62 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  26.59 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  29.37 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  26.48 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  26.49 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  26.21 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  25.35 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  31.44 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.08 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.86 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  27.41 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  27.31 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  27.5 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  27.32 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  26.9 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  26.9 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  27.46 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  23.08 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 		 333 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  25.76 
 
 		 312 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  21.8 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  25.68 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  24.78 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  22.81 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  24.7 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  24.69 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  26.37 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  24.26 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  25.51 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  26.07 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 		 246 aa  53.9  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  28.38 
 
 		 644 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  21.7 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  24.79 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  21.76 
 
 		 249 aa  50.4  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 		 313 aa  50.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  23.39 
 
 		 246 aa  49.7  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 		 272 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  21.24 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  24.22 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  24.9 
 
 		 262 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  22.83 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0225  SoxH protein-like  21.81 
 
 		 378 aa  46.2  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.986095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  23.17 
 
 		 309 aa  45.8  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  25.45 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  21.17 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  24.36 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  27.7 
 
 		 637 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  20.94 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>