39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0722 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  808    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  54.29 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  48.06 
 
 		 391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  42.64 
 
 		 416 aa  301  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  47.15 
 
 		 393 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  44.86 
 
 		 394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  40.12 
 
 		 391 aa  230  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  37.93 
 
 		 420 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  39.41 
 
 		 397 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  36.81 
 
 		 393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  37.18 
 
 		 427 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  35.57 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  36.71 
 
 		 429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  37.36 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  37.54 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  39.34 
 
 		 411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  36.42 
 
 		 422 aa  213  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  39.53 
 
 		 402 aa  213  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  38.24 
 
 		 392 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  36.23 
 
 		 400 aa  206  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  37.01 
 
 		 395 aa  206  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  35.24 
 
 		 429 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  35.77 
 
 		 423 aa  202  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  35.42 
 
 		 424 aa  202  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  39.06 
 
 		 408 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  39.06 
 
 		 408 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  39.66 
 
 		 386 aa  201  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  38.78 
 
 		 408 aa  201  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  40.15 
 
 		 423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  39.11 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  34.88 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  36.78 
 
 		 400 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  34.59 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  34.02 
 
 		 408 aa  188  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  32.5 
 
 		 395 aa  183  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  23.13 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  22.62 
 
 		 432 aa  43.5  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  21.34 
 
 		 413 aa  43.5  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>