More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0693 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  100 
 
 
81 aa  168  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  94.67 
 
 
85 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  76.32 
 
 
82 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  76.32 
 
 
82 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  74.36 
 
 
82 aa  130  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  74.03 
 
 
80 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5528  BolA family protein  69.14 
 
 
82 aa  127  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750325  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  71.6 
 
 
82 aa  124  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  66.67 
 
 
80 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3114  BolA-like protein  62.5 
 
 
82 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203457  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3251  BolA-like protein  64.94 
 
 
81 aa  110  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2762  BolA family protein  66.22 
 
 
79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2954  hypothetical protein  66.22 
 
 
78 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3563  BolA family protein  66.22 
 
 
79 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480787  hitchhiker  0.0000372563 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2885  BolA family protein  64.86 
 
 
78 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3232  BolA family protein  64.86 
 
 
80 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0349  BolA family protein  64.86 
 
 
79 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802169  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3520  BolA-like protein  64.86 
 
 
79 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2685  BolA-like protein  64.86 
 
 
79 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0401  BolA family protein  64.86 
 
 
79 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0340  BolA family protein  64.86 
 
 
79 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0422  BolA family protein  64.86 
 
 
79 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0395  putative morphogene protein, BolA  64.86 
 
 
79 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0325  BolA family protein  64.86 
 
 
79 aa  103  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2717  BolA/YrbA family protein  66.22 
 
 
79 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3696  BolA-like protein  66.22 
 
 
79 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3669  BolA/YrbA family protein  66.22 
 
 
79 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2996  BolA/YrbA family protein-related protein  66.22 
 
 
79 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3727  BolA/YrbA family protein  66.22 
 
 
79 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1785  BolA/YrbA family protein  66.22 
 
 
79 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3236  BolA/YrbA family protein  66.22 
 
 
79 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330448  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2768  BolA/YrbA family protein  66.22 
 
 
79 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0104  BolA family protein  52.5 
 
 
82 aa  98.2  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0828  BolA family transcriptional regulator  53.75 
 
 
92 aa  97.8  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.997437  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0103  BolA family protein  50.65 
 
 
79 aa  94  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0570804  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1584  BolA family protein  61.97 
 
 
92 aa  94  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0325559 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1892  hypothetical protein  51.95 
 
 
88 aa  89.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0244  BolA-like protein  48.15 
 
 
83 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447215  normal  0.0978387 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  48.72 
 
 
81 aa  84  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  41.77 
 
 
80 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0355  BolA family protein  48.05 
 
 
80 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0345448  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  48.61 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  44.87 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  41.03 
 
 
85 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0260  toluene-tolerance protein, putative  40.79 
 
 
82 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2742  BolA-like protein  42.68 
 
 
83 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1146  hypothetical protein  40.48 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0590  BolA-like protein  41.33 
 
 
80 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3171  toluene-tolerance protein, putative  36.25 
 
 
80 aa  67  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.645971  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0960  BolA family protein  44 
 
 
76 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.279652 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2097  BolA family protein  34.18 
 
 
84 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03055  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.53 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0198395  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0517  BolA family protein  35.53 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000427733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4512  BolA/YrbA family protein  35.53 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00331661  normal  0.461859 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0510  BolA family protein  35.53 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983547  normal  0.100311 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03006  hypothetical protein  35.53 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0149575  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  40.54 
 
 
83 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3486  BolA/YrbA family protein  35.53 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.142605  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3676  BolA/YrbA family protein  35.53 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000542311  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3580  BolA/YrbA family protein  35.53 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0837245  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02233  BolA superfamily transcriptional regulator  44 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3569  hypothetical protein  35.53 
 
 
84 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659665  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3605  hypothetical protein  35.53 
 
 
84 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3498  protein YrbA  35.53 
 
 
84 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00460325  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3667  hypothetical protein  35.53 
 
 
84 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16024  normal  0.0806875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3500  protein YrbA  35.53 
 
 
84 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0696  BolA family protein  43.42 
 
 
79 aa  63.5  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00104448  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1481  BolA  43.42 
 
 
79 aa  63.5  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.491257  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2585  BolA family protein  38.96 
 
 
78 aa  63.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6655  normal  0.361888 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1905  hypothetical protein  31.65 
 
 
83 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000031102  normal  0.0113289 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2646  BolA family protein  44 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3037  BolA family protein  44 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0006  BolA family protein  41.56 
 
 
78 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2195  BolA-like protein  31.65 
 
 
83 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.083862  decreased coverage  0.00880856 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1023  BolA family protein  38.67 
 
 
77 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15015  normal  0.871114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5266  BolA family protein  37.33 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11515 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3626  BolA family protein  34.67 
 
 
84 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00172432  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0013  BolA family protein  38.96 
 
 
78 aa  62  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0874253  normal  0.885333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0012  BolA family protein  38.96 
 
 
78 aa  62  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  46.88 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2050  BolA family protein  35.44 
 
 
80 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0500  BolA family protein  31.25 
 
 
84 aa  62  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3803  BolA family protein  33.33 
 
 
84 aa  61.6  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00264294  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2520  BolA-like protein  41.33 
 
 
77 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269004  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2783  BolA family protein  37.33 
 
 
78 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  37.5 
 
 
85 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  0.00000272447 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0286  BolA family protein  34.67 
 
 
84 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03653  hypothetical protein  30.38 
 
 
84 aa  61.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  37.5 
 
 
85 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3598  BolA family protein  50 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00692216  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0676  BolA family protein  41.33 
 
 
75 aa  60.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  39.29 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0011  BolA family protein  38.96 
 
 
78 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002414  protein yrbA  30.38 
 
 
84 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0009  BolA family protein  38.96 
 
 
78 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03668  BolA protein  40.7 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1644  bolA protein  55.32 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.448152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  48.33 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0864  BolA family protein  35.53 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0510  hypothetical protein  31.58 
 
 
85 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>