117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0656 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0656  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  219  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00883836  decreased coverage  0.00160249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0755  hypothetical protein  71.96 
 
 		 109 aa  168  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  54.13 
 
 		 109 aa  126  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2568  hypothetical protein  59.63 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000926681  normal  0.0635574 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  48.08 
 
 		 115 aa  92.8  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  39.81 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  42.61 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  44.76 
 
 		 116 aa  90.1  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  43.14 
 
 		 114 aa  87.8  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  54.55 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  43.52 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  43.52 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  39.82 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  36.28 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  43.27 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  38.71 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  37.7 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  37.7 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2604  hypothetical protein  40.48 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  39.25 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  36.89 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  43.37 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4038  hypothetical protein  38 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511833  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  36.64 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1841  protein of unknown function DUF805  43.1 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  36.61 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  41.28 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  41.28 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  41.28 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  41.28 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  39.81 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2599  protein of unknown function DUF805  48.15 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129685 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  38.89 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  38.89 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  38.89 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  38.89 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  38.89 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  36.36 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  38.89 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2214  protein of unknown function DUF805  41.11 
 
 		 215 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  43.9 
 
 		 393 aa  67.4  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  38.83 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3455  hypothetical protein  40.45 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0992  hypothetical protein  41.67 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  37.04 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  37.04 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  37.04 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1013  hypothetical protein  43.68 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  31.25 
 
 		 131 aa  62  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  36.84 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0427  hypothetical protein  35.58 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.082341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4205  hypothetical protein  33.64 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  34.31 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1966  protein of unknown function DUF805  40.78 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  31.86 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  31.86 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  34.17 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  31.86 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  31.86 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  31.86 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  31.86 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  31.86 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  31.86 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  31.86 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  32.23 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  32.28 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  33.66 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  35.83 
 
 		 138 aa  57  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20900  predicted membrane protein  35.65 
 
 		 137 aa  57  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.761588  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4114  protein of unknown function DUF805  36.84 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  31.75 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  39.66 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4184  protein of unknown function DUF805  31.78 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.150084  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2197  protein of unknown function DUF805  32.35 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3452  hypothetical protein  45.28 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  30.89 
 
 		 193 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1868  protein of unknown function DUF805  35.79 
 
 		 188 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2214  hypothetical protein  35.79 
 
 		 188 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.573949  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1482  protein of unknown function DUF805  30.43 
 
 		 371 aa  50.8  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.118245  normal  0.324958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0829  hypothetical protein  28.18 
 
 		 194 aa  50.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3187  protein of unknown function DUF805  27.87 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.658779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  38.1 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1123 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2367  hypothetical protein  28.44 
 
 		 206 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2412  hypothetical protein  28.44 
 
 		 206 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03806  conserved inner membrane protein  40.28 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4064  protein of unknown function DUF805  40.28 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0175  hypothetical protein  36.36 
 
 		 214 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3557  hypothetical protein  35.53 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4455  hypothetical protein  40.28 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4097  hypothetical protein  40.28 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4361  hypothetical protein  40.28 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375451 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03755  hypothetical protein  40.28 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5376  hypothetical protein  40.28 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4401  hypothetical protein  40.28 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3806  protein of unknown function DUF805  37.5 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0156  hypothetical protein  37.33 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4299  hypothetical protein  40.28 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4329  hypothetical protein  40.28 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>