43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0569 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0569  cytochrome c, class II  100 
 
 		 158 aa  323  8.000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3283  cytochrome c, class II  57.04 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00438456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0107  cytochrome c prime  45.83 
 
 		 150 aa  110  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49090  Cytochrome C, class II  48.09 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.472535  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0327  cytochrome c, class II  41.61 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.781322  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1340  cytochrome c prime  36.71 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000194758 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3537  cytochrome c prime  33.82 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0147332 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0600  cytochrome c, class II  33.78 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0462  cytochrome c'  27.27 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0474  cytochrome c, class II  34.42 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.731529  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0404  cytochrome c prime  32.19 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0286  cytochrome c prime  36.23 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0933227  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1123  cytochrome c prime  31.3 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000239105  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0291  cytochrome c, class II  36.23 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000294803 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2544  cytochrome c, class II  30.22 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0216  cytochrome c, class II  31.16 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1277  cytochrome c, class II  32.84 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0269  cytochrome c, class II  32.58 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1266  cytochrome c prime  29.38 
 
 		 153 aa  51.2  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1205  cytochrome c, class II  26.88 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000342907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1135  cytochrome c, class II  26.88 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000323618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1062  cytochrome c class II  27.74 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.251364  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1171  cytochrome c, class II  27.04 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3420  cytochrome c'  25.62 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1225  cytochrome c prime  25.62 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.239177 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1134  cytochrome c, class II  26.45 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0901  cytochrome c, class II  27.61 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.502133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0474  cytochrome c'  28.35 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2126  cytochrome c, class II  28.35 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1223  cytochrome c, class II  25.47 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000308946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1267  cytochrome c class II  25.47 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000308815  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3090  cytochrome c prime  25.47 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000689857  normal  0.0144373 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2744  cytochrome c, class II  28.93 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2396  cytochrome c, class II  30.23 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00865436  normal  0.433653 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1300  cytochrome c prime  27.33 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000571925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2738  cytochrome c, class II  27.04 
 
 		 149 aa  44.3  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000239572  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2785  cytochrome c-554  26.62 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1427  cytochrome c, class II  26.8 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466816  normal  0.0348813 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02251  cytochrome c  25.16 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1455  cytochrome c, class II  23.53 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1075  cytochrome c, class II  26.77 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1163  cytochrome c, class II  23.66 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1325  cytochrome c, class II  26.92 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>