More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0546 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  481  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  58.85 
 
 		 270 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  57.61 
 
 		 270 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  57.61 
 
 		 270 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  58.16 
 
 		 273 aa  272  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  58.4 
 
 		 276 aa  270  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 		 232 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4329  ABC transporter related  54.69 
 
 		 243 aa  247  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.413281  normal  0.920294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2514  ABC transporter  57.55 
 
 		 237 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  55.76 
 
 		 262 aa  241  7.999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19520  ABC transporter ATP-binding protein  51.79 
 
 		 249 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1680  ABC transporter ATP-binding protein  51.39 
 
 		 249 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  53.25 
 
 		 287 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  52.03 
 
 		 287 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  52.63 
 
 		 269 aa  229  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  47.28 
 
 		 255 aa  228  9e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.65 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  51.75 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  51.07 
 
 		 252 aa  224  7e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  52.07 
 
 		 266 aa  224  9e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  53.46 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  50.2 
 
 		 279 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  52 
 
 		 286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  50.2 
 
 		 279 aa  221  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 251 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  55.11 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  51.11 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  44.54 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  46.29 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  53.85 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 		 251 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  46.59 
 
 		 271 aa  215  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  50.45 
 
 		 261 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  52.16 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  43.7 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.05 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  44.54 
 
 		 287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  44.54 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  44.54 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  52.49 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  52.49 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  52.49 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2893  ABC transporter related  52.61 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  51.58 
 
 		 260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  52.04 
 
 		 281 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  51.82 
 
 		 259 aa  211  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4965  ABC transporter related  56.37 
 
 		 253 aa  211  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  48.95 
 
 		 245 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  48.87 
 
 		 265 aa  210  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  44.89 
 
 		 262 aa  209  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0779  ABC transporter related  48.28 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  51.58 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  49.12 
 
 		 278 aa  206  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  49.34 
 
 		 285 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  50.88 
 
 		 259 aa  205  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  42.99 
 
 		 247 aa  205  5e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  53.05 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  51.11 
 
 		 255 aa  204  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  50.44 
 
 		 259 aa  204  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  49.32 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1539  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.99 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  49.32 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50.88 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  49.06 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  49.77 
 
 		 288 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  48.77 
 
 		 259 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  48.4 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  46.46 
 
 		 259 aa  200  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  49.09 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  48 
 
 		 255 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4216  ABC transporter related  49.08 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.66 
 
 		 284 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  48.6 
 
 		 274 aa  198  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  44.69 
 
 		 265 aa  198  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  47.62 
 
 		 307 aa  198  7e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  46.92 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0023  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.11 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  46.47 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.3 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  44.25 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0029  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.88 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.05113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1735  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.77 
 
 		 257 aa  195  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  48.98 
 
 		 259 aa  195  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  43.21 
 
 		 244 aa  195  6e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  44.21 
 
 		 244 aa  195  6e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  48.64 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4972  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.23 
 
 		 270 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243489  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  50.48 
 
 		 291 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  45.41 
 
 		 261 aa  194  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1974  ABC transporter related  50 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  45.13 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  47.95 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  46.55 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2881  ABC transporter related  49.78 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1384  ABC transporter related protein  47.72 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0283767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0240  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.79 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10949  hitchhiker  0.000841582 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  43.6 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0255  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.79 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.213675  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  50.23 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>