More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0532 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0532  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 276 aa  570  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4040  Crp/FNR family transcriptional regulator  65.61 
 
 		 256 aa  346  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2201  transcriptional regulator  58.05 
 
 		 262 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.586423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0997  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  64.47 
 
 		 230 aa  311  6.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1734  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.93 
 
 		 241 aa  244  9e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  hitchhiker  0.000773544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.46 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.523077  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1787  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  44.73 
 
 		 263 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1153  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.49 
 
 		 250 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2400  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 250 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0375093 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3844  cyclic nucleotide-binding protein  41.6 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5989  transcriptional regulator CRP family  42.86 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1275  Crp/Fnr family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2934  cyclic nucleotide-binding protein  43.09 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2705  cyclic nucleotide-binding protein  41.39 
 
 		 249 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3568  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.75 
 
 		 242 aa  172  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3486  putative signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173486 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0604  cyclic nucleotide-binding protein  34.84 
 
 		 246 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1953  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0490  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3616  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 243 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.34 
 
 		 250 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal  0.182435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.22 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6209  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0102902  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7477  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.03 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0983  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7493  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.29 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3758  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.58 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.63 
 
 		 384 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4564  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00106309 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1854  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.191124  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.18 
 
 		 384 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1230  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4497  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 		 255 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140276  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4876  cyclic nucleotide-binding  28.97 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5361  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.97 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1991  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.65 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2886  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.8 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3389  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.91 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0133  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.52 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  0.0379159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2763  cyclic nucleotide-binding  30.41 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2990  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.41 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.79 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5030  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.3 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3926  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.3 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2207  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.82 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.11 
 
 		 249 aa  105  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582037  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0073  cyclic nucleotide-binding  29.58 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  29.15 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2301  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.1 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6249  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0422  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.6 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2024  cyclic nucleotide-binding  34.1 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.996332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1427  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.96 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0196  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0367027  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4270  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 225 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0946  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1439  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 243 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2367  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.78 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0615204  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1986  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.53 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2575  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3865  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1441  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 259 aa  99  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010652 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0189  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 235 aa  99  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2950  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0654  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2433  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 247 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168738  normal  0.817452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3788  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.98 
 
 		 249 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3322  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 262 aa  96.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0702622  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3480  cyclic nucleotide-binding  30.67 
 
 		 249 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6132  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0884478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0647  nitrogen fixation regulation protein fixk  31.48 
 
 		 251 aa  95.9  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1485  cyclic nucleotide-binding protein  29.44 
 
 		 244 aa  95.5  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4036  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1357  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0953  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6403  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1377  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0772  cyclic nucleotide-binding  29.5 
 
 		 254 aa  94  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3367  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0266  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2634  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4822  cyclic nucleotide-binding protein  28 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1302  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4713  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.64 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557049  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0414  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.766284  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0357  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4039  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1557  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.28 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00717235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0859  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 234 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.85 
 
 		 246 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0738845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4729  transcriptional regulator FixK  33.33 
 
 		 230 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1258  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 241 aa  89  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1357  cyclic nucleotide-binding  28.51 
 
 		 250 aa  89  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.395788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 236 aa  89  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342582  normal  0.0135439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4786  cyclic nucleotide-binding protein  25.54 
 
 		 243 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3832  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34 
 
 		 245 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1835  cyclic nucleotide-binding protein  27.51 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2686  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.85 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.038663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1984  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.73 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.312779  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>