More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0503 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0503  helicase c2  100 
 
 		 750 aa  1530    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4469  Rad3-related DNA helicases-like protein  79.03 
 
 		 330 aa  531  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0968334  hitchhiker  7.6564e-18 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2033  ATP-dependent DNA helicase DinG  39.63 
 
 		 716 aa  428  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2732  ATP-dependent DNA helicase DinG  40.78 
 
 		 738 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196414  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4158  ATP-dependent DNA helicase DinG  40.03 
 
 		 758 aa  411  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0014  ATP-dependent DNA helicase DinG  40.03 
 
 		 729 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0013  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.93 
 
 		 741 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0021  ATP-dependent DNA helicase DinG  39.38 
 
 		 692 aa  395  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  36.74 
 
 		 714 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.6 
 
 		 714 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1427  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.55 
 
 		 714 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.44 
 
 		 714 aa  372  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.8 
 
 		 714 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.74 
 
 		 714 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.69 
 
 		 720 aa  362  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.7 
 
 		 714 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.22 
 
 		 714 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.06 
 
 		 714 aa  361  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.06 
 
 		 714 aa  361  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.82 
 
 		 708 aa  360  6e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.8 
 
 		 721 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.17 
 
 		 714 aa  358  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.12 
 
 		 725 aa  357  5e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.67 
 
 		 691 aa  353  8e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.85 
 
 		 712 aa  350  4e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.56 
 
 		 692 aa  349  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.42 
 
 		 707 aa  348  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.22 
 
 		 691 aa  344  4e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.66 
 
 		 694 aa  343  9e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.26 
 
 		 690 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.39 
 
 		 690 aa  341  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.26 
 
 		 690 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.64 
 
 		 690 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.26 
 
 		 690 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.95 
 
 		 690 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.26 
 
 		 690 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  34.55 
 
 		 691 aa  340  4e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.64 
 
 		 692 aa  341  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.67 
 
 		 690 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.45 
 
 		 690 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.36 
 
 		 690 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.68 
 
 		 691 aa  337  5e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.96 
 
 		 690 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2178  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.8 
 
 		 686 aa  336  1e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.21 
 
 		 691 aa  334  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.64 
 
 		 703 aa  329  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107544  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2856  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.04 
 
 		 726 aa  324  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.642331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2777  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.04 
 
 		 726 aa  324  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1321  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.04 
 
 		 726 aa  323  7e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2398  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.72 
 
 		 715 aa  317  4e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.927767  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0857  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.83 
 
 		 714 aa  317  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0884  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.83 
 
 		 714 aa  316  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0916  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.69 
 
 		 714 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0969  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.83 
 
 		 714 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.83 
 
 		 714 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1461  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.82 
 
 		 732 aa  315  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.498771 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.83 
 
 		 711 aa  312  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.13 
 
 		 700 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1289  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.82 
 
 		 725 aa  308  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2495  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.54 
 
 		 701 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0853  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.43 
 
 		 716 aa  301  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2844  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.43 
 
 		 716 aa  301  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0506897 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.29 
 
 		 762 aa  301  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2553  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.29 
 
 		 716 aa  300  6e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2910  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.03 
 
 		 699 aa  300  6e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00766  ATP-dependent DNA helicase  31.29 
 
 		 716 aa  300  9e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2843  helicase c2  31.29 
 
 		 716 aa  300  9e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0866  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.29 
 
 		 716 aa  300  9e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00783  hypothetical protein  31.29 
 
 		 716 aa  300  9e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0823  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.29 
 
 		 716 aa  299  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1552  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.78 
 
 		 699 aa  295  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.92 
 
 		 710 aa  292  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  31.66 
 
 		 659 aa  268  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.46 
 
 		 957 aa  254  6e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  28.83 
 
 		 929 aa  249  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  25.89 
 
 		 832 aa  249  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  33.48 
 
 		 633 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  32.33 
 
 		 757 aa  248  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  33.19 
 
 		 633 aa  248  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  30.04 
 
 		 838 aa  245  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  30.03 
 
 		 643 aa  241  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  31.91 
 
 		 755 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  32.5 
 
 		 751 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  29.8 
 
 		 851 aa  237  6e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.67 
 
 		 929 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  32.25 
 
 		 743 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  29.86 
 
 		 658 aa  235  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.18 
 
 		 944 aa  234  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  32.55 
 
 		 755 aa  235  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.85 
 
 		 934 aa  234  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2207  putative ATP-dependent helicase  32.75 
 
 		 749 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3670  helicase c2  30.17 
 
 		 664 aa  232  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.978483  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.18 
 
 		 934 aa  232  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1086  putative ATP-dependent helicase  32.1 
 
 		 752 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00956322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.34 
 
 		 934 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2170  putative ATP-dependent helicase  32.1 
 
 		 752 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.779886  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1326  ATP-dependent helicase, putative  32.1 
 
 		 752 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0729389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.34 
 
 		 934 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0081  putative ATP-dependent helicase  32.1 
 
 		 752 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892999  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1815  putative ATP-dependent helicase  32.1 
 
 		 752 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>