More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0502 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0502  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  100 
 
 
121 aa  248  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4109  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  96.67 
 
 
121 aa  240  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4049  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  93.39 
 
 
121 aa  238  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0629  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  92.56 
 
 
124 aa  234  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0608  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  92.56 
 
 
124 aa  234  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581475  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4676  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  92.5 
 
 
121 aa  234  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0725  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  91.67 
 
 
120 aa  233  8e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2642  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  90.83 
 
 
121 aa  231  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0615003  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3448  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  85.83 
 
 
121 aa  223  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0379124 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3153  putative HesB-like protein  84.17 
 
 
121 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937161 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  82.11 
 
 
123 aa  209  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  82.11 
 
 
123 aa  207  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2343  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  81.97 
 
 
122 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3419  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  81.97 
 
 
122 aa  207  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2521  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  81.97 
 
 
122 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  81.97 
 
 
122 aa  207  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525551  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1117  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  81.97 
 
 
122 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0255  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  81.97 
 
 
122 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3412  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  81.97 
 
 
122 aa  207  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3376  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  81.97 
 
 
122 aa  207  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000296578  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0370  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  81.45 
 
 
124 aa  207  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828818  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0385  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  81.45 
 
 
124 aa  207  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105816  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5912  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  93.33 
 
 
124 aa  207  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106934  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2562  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  80.99 
 
 
121 aa  207  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000254091  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  81.3 
 
 
123 aa  207  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  81.3 
 
 
123 aa  207  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0494  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  80.65 
 
 
124 aa  206  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0609  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  80.17 
 
 
121 aa  205  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000901773  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3352  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  80.17 
 
 
121 aa  205  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00016934  hitchhiker  0.0000376167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0414  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  81.97 
 
 
122 aa  204  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0471  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  81.97 
 
 
122 aa  204  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0242787  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  84.68 
 
 
123 aa  201  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  84.68 
 
 
123 aa  201  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  84.68 
 
 
123 aa  201  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0456  HesB-like protein  78.95 
 
 
116 aa  192  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00139708  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1587  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  79.09 
 
 
128 aa  191  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000319223  normal  0.730386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  79.82 
 
 
116 aa  191  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  78.18 
 
 
124 aa  189  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0104444  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  72.5 
 
 
117 aa  185  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  79.82 
 
 
116 aa  184  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0556  HesB/YadR/YfhF  74.11 
 
 
113 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.208955  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2408  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  70.25 
 
 
120 aa  176  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00136541  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3930  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  67.83 
 
 
116 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0777842  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  70 
 
 
110 aa  170  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0403  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  71.17 
 
 
126 aa  169  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0292839  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1044  HesB/YadR/YfhF  69.3 
 
 
116 aa  169  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0515022  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  68.75 
 
 
113 aa  169  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46030  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  66.09 
 
 
116 aa  169  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  72.12 
 
 
130 aa  167  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2142  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  68.52 
 
 
120 aa  165  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.569237  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3067  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  72.48 
 
 
124 aa  164  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2673  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  72.48 
 
 
124 aa  164  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.407171  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0806  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  63.48 
 
 
116 aa  163  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08510  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  63.48 
 
 
116 aa  163  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.64455  hitchhiker  0.000000019455 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4770  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  63.48 
 
 
132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00616694  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0433  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  63.48 
 
 
132 aa  159  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282495  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0463  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  63.48 
 
 
132 aa  159  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0092949  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0466  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  63.48 
 
 
132 aa  159  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.147286  hitchhiker  0.00198975 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0836  hypothetical protein  62.83 
 
 
117 aa  159  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132349  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1567  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  65.45 
 
 
125 aa  159  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.679568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5101  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  62.61 
 
 
116 aa  158  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105722  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1012  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  64.49 
 
 
115 aa  157  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0605  HesB/YadR/YfhF family protein  62.61 
 
 
116 aa  157  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4568  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  62.61 
 
 
116 aa  157  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420029  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002592  probable iron binding protein from the HesB_IscA_SufA family  61.95 
 
 
113 aa  155  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000217279  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03416  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  61.61 
 
 
118 aa  156  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0867  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  61.4 
 
 
118 aa  155  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0569822  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1442  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  64.55 
 
 
124 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402332  hitchhiker  0.0055287 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2815  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  63.72 
 
 
116 aa  155  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0995979  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3101  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  66.36 
 
 
115 aa  155  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01609  HesB protein family  60.53 
 
 
116 aa  154  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2976  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  62.83 
 
 
116 aa  154  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  63.06 
 
 
114 aa  154  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1123  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  62.83 
 
 
116 aa  154  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1176  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  64.49 
 
 
115 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2889  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  62.83 
 
 
116 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113097  hitchhiker  0.000000819699 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2971  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  62.83 
 
 
116 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141042  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3067  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  62.83 
 
 
116 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0351916  hitchhiker  0.000000150734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0242  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  61.26 
 
 
114 aa  153  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132384  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4622  HesB/YadR/YfhF family protein  66.36 
 
 
113 aa  153  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1038  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  61.26 
 
 
114 aa  153  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0241  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  61.26 
 
 
114 aa  153  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0227  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  61.26 
 
 
114 aa  153  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1362  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  60.53 
 
 
139 aa  153  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0224  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  61.26 
 
 
114 aa  153  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0225  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  61.26 
 
 
114 aa  153  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0632287  normal  0.831561 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2809  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  62.16 
 
 
114 aa  153  7e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00155  hypothetical protein  61.26 
 
 
114 aa  153  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0844393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3446  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  61.26 
 
 
114 aa  153  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0166  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  61.26 
 
 
114 aa  153  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0161  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  61.26 
 
 
114 aa  153  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3503  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  61.26 
 
 
114 aa  153  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.911053  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0168  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  61.26 
 
 
114 aa  153  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0148  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  61.26 
 
 
114 aa  153  8e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0160  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  61.26 
 
 
114 aa  153  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00154  hypothetical protein  61.26 
 
 
114 aa  153  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0585219  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0435  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  61.48 
 
 
122 aa  153  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.0210981 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0985  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  63.72 
 
 
116 aa  152  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243012  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1304  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  65.42 
 
 
108 aa  152  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1203  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  61.02 
 
 
122 aa  152  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.592429  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>