More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0492 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  100 
 
 		 238 aa  471  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  52.97 
 
 		 213 aa  174  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4680  rare lipoprotein A  63.16 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  62.77 
 
 		 324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  49.63 
 
 		 358 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 360 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 360 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  43.48 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  40.37 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  50 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0601  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  58.59 
 
 		 335 aa  123  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4056  rare lipoprotein A  61.8 
 
 		 108 aa  122  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.926393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  45.04 
 
 		 163 aa  122  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  36.79 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  60.4 
 
 		 212 aa  121  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0622  rare lipoprotein A  56.03 
 
 		 175 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.717997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  59.78 
 
 		 181 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  61.96 
 
 		 409 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  58.51 
 
 		 297 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  63.33 
 
 		 200 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  50.4 
 
 		 162 aa  115  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  50 
 
 		 163 aa  115  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  55.24 
 
 		 285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  62.22 
 
 		 227 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  44.03 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  48.09 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  60.44 
 
 		 381 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  50 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  38.02 
 
 		 258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  56.73 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  56.84 
 
 		 139 aa  113  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  61.96 
 
 		 162 aa  113  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  62.22 
 
 		 200 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  55.34 
 
 		 323 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  52.1 
 
 		 134 aa  113  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  59.55 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  66.67 
 
 		 94 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  55.24 
 
 		 286 aa  112  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  62.22 
 
 		 114 aa  112  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  49.53 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 171 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  54.29 
 
 		 168 aa  111  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  58.7 
 
 		 175 aa  111  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  47.11 
 
 		 170 aa  111  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  56.31 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 198 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  54.44 
 
 		 246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 277 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 321 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  54.74 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  54.46 
 
 		 331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 150 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  51.92 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  38.07 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 121 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  42.97 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  55.56 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  42.97 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  42.97 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  35.1 
 
 		 471 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  34.39 
 
 		 417 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  54.44 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  46.23 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  34.39 
 
 		 415 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  50.49 
 
 		 166 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  54.44 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  54.44 
 
 		 230 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  54.44 
 
 		 230 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  56.18 
 
 		 163 aa  108  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  59.09 
 
 		 165 aa  108  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  55.56 
 
 		 239 aa  109  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  62.5 
 
 		 121 aa  108  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  37.79 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  54.44 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  54.44 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  52.38 
 
 		 339 aa  108  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  54.44 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  60.44 
 
 		 122 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  57.78 
 
 		 124 aa  108  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  56.82 
 
 		 171 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  57.78 
 
 		 318 aa  108  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 121 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 140 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  56.84 
 
 		 157 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  49.51 
 
 		 263 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 124 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  48.54 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  58.89 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  50 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>