232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0431 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 309 aa  636    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  74.92 
 
 		 306 aa  481  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  57.67 
 
 		 308 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  56.11 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  61.49 
 
 		 308 aa  351  8e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  59.08 
 
 		 308 aa  345  6e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  57.68 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  55.15 
 
 		 317 aa  335  7e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  52.12 
 
 		 319 aa  325  6e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0583  beta-lactamase domain-containing protein  53.2 
 
 		 307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266418 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  52.03 
 
 		 314 aa  285  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  50.83 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  52.76 
 
 		 306 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  52.76 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  47.52 
 
 		 317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  53.91 
 
 		 306 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  47.72 
 
 		 319 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0111  beta-lactamase domain protein  48.18 
 
 		 317 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  43.23 
 
 		 304 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  43.43 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  28.52 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  32.65 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  24.79 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  29.06 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  24.77 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  28.11 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  31.1 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  31.55 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0402  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  28.04 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  26.19 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  28.04 
 
 		 214 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  25.4 
 
 		 246 aa  55.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 		 217 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  20.96 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  25.4 
 
 		 246 aa  55.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  31.21 
 
 		 214 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.86 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  28.04 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  25.39 
 
 		 313 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.32 
 
 		 208 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  28.92 
 
 		 222 aa  53.9  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  28.04 
 
 		 214 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  22.83 
 
 		 304 aa  53.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  25.52 
 
 		 249 aa  53.1  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5095  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 		 293 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.046641  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  26.24 
 
 		 312 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.49 
 
 		 260 aa  52.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  25 
 
 		 213 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.43 
 
 		 214 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  23.83 
 
 		 213 aa  52.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  24.02 
 
 		 231 aa  52.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.48 
 
 		 278 aa  52.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  27.08 
 
 		 205 aa  52  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  27.41 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  29.51 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  28.67 
 
 		 215 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  27.96 
 
 		 214 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 		 226 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  28.43 
 
 		 214 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  28.65 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 215 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  27.37 
 
 		 214 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 		 231 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  27.92 
 
 		 214 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  26.49 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  27.97 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  27.97 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  27.97 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  30.09 
 
 		 207 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  27.92 
 
 		 214 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  27.92 
 
 		 214 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  28.69 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  27.92 
 
 		 214 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  27.92 
 
 		 214 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  25.73 
 
 		 204 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  23.53 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  22.83 
 
 		 212 aa  50.4  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  27.08 
 
 		 217 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 217 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  26.4 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.97 
 
 		 215 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.97 
 
 		 215 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.97 
 
 		 215 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 		 215 aa  49.7  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.97 
 
 		 215 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.97 
 
 		 215 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  27.27 
 
 		 215 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 215 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  27.27 
 
 		 215 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0544  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 		 208 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.591388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 		 214 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>