140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0372 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4260  methyltransferase type 12  77.7 
 
 		 441 aa  721    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  100 
 
 		 441 aa  912    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  39.95 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  32.08 
 
 		 414 aa  126  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  27.62 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  31.55 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  27.03 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  28.25 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  26.8 
 
 		 395 aa  111  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  30.18 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  30.18 
 
 		 400 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  32.22 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.05 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 779 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  29.39 
 
 		 779 aa  97.8  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.9 
 
 		 865 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  28.02 
 
 		 580 aa  87.8  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  32.57 
 
 		 780 aa  87  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12103  hypothetical protein  28.31 
 
 		 407 aa  87  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00110715  normal  0.946541 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0481  hypothetical protein  29.56 
 
 		 398 aa  86.7  8e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.874719  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  29.92 
 
 		 653 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  24.85 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.74 
 
 		 875 aa  83.2  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1676 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  34.27 
 
 		 631 aa  80.9  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1047  hypothetical protein  30.2 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 661 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  30.05 
 
 		 704 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0721  hypothetical protein  28.57 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.38 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1065  methyltransferase type 12  28.93 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3879  Methyltransferase type 12  26.5 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  29.71 
 
 		 441 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  29.71 
 
 		 441 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3967  Methyltransferase type 12  26.18 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000336938 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  35.51 
 
 		 268 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  37.25 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  29.69 
 
 		 274 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3000  Methyltransferase type 12  26.63 
 
 		 370 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 252 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 276 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  28.25 
 
 		 257 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 266 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  29.75 
 
 		 542 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.64 
 
 		 245 aa  50.1  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.48 
 
 		 258 aa  50.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 261 aa  50.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 268 aa  49.7  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.97 
 
 		 261 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 261 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 272 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  30.97 
 
 		 261 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  30.97 
 
 		 261 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  30.97 
 
 		 261 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  30.97 
 
 		 261 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  30.97 
 
 		 261 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  30.97 
 
 		 261 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  30.97 
 
 		 261 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  30.17 
 
 		 258 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 215 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  27.49 
 
 		 535 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  32.11 
 
 		 260 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  31.19 
 
 		 256 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 366 aa  47.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 275 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 268 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.03 
 
 		 244 aa  47.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  26.36 
 
 		 278 aa  47.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.16 
 
 		 236 aa  47  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  30.14 
 
 		 285 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 344 aa  47  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 258 aa  47  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  32.11 
 
 		 256 aa  46.6  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  32.11 
 
 		 254 aa  46.6  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  30.77 
 
 		 267 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  30.77 
 
 		 267 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  23.73 
 
 		 241 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  33.04 
 
 		 284 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 285 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 285 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  24.39 
 
 		 494 aa  46.2  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 257 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  30.77 
 
 		 267 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  30.77 
 
 		 267 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  30.77 
 
 		 267 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  36.36 
 
 		 265 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  27.13 
 
 		 351 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 257 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.07 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 266 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>