More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0232 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0232  sucrose phosphorylase  100 
 
 		 493 aa  1014    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3361  alpha amylase catalytic region  59.41 
 
 		 491 aa  551  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0061  sucrose phosphorylase  52.64 
 
 		 492 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1331  sucrose phosphorylase  57.24 
 
 		 508 aa  537  1e-151  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00201506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4288  sucrose phosphorylase  53.42 
 
 		 492 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00965772  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0066  sucrose phosphorylase  52.44 
 
 		 492 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.530318  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0064  sucrose phosphorylase  53.77 
 
 		 494 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0062  sucrose phosphorylase  53.77 
 
 		 494 aa  534  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0945971  unclonable  0.0000350237 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0066  sucrose phosphorylase  53.77 
 
 		 494 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000218626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0065  sucrose phosphorylase  52.24 
 
 		 492 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01971  sucrose phosphorylase  53.99 
 
 		 498 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3990  sucrose phosphorylase  52.45 
 
 		 493 aa  508  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00149762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0651  sucrose phosphorylase  39.42 
 
 		 482 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0824794  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0241  Sucrose phosphorylase  37.78 
 
 		 483 aa  348  2e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1779  glycosidase  37.37 
 
 		 489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0384  glycosidase  37.31 
 
 		 492 aa  333  3e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00983965  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1542  sucrose phosphorylase  36.23 
 
 		 485 aa  318  1e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.296567  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1771  alpha amylase catalytic region  29.4 
 
 		 585 aa  201  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1248  alpha amylase catalytic region  34.27 
 
 		 568 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55232  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0665  alpha amylase catalytic region  30.69 
 
 		 555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.694695  normal  0.614349 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2600  sucrose phosphorylase  30.84 
 
 		 591 aa  195  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2164  alpha amylase, catalytic region  31.02 
 
 		 586 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.659302  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0418  alpha amylase, catalytic region  31.12 
 
 		 577 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.537622  normal  0.197095 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01286  predicted glucosyltransferase  28.92 
 
 		 559 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1519  alpha amylase family protein  28.92 
 
 		 559 aa  188  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2316  alpha amylase catalytic region  28.92 
 
 		 559 aa  188  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.278573  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2337  alpha amylase catalytic region  29.01 
 
 		 559 aa  187  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459721  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1424  alpha amylase family protein  28.92 
 
 		 559 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2165  alpha amylase, catalytic region  29.32 
 
 		 565 aa  187  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  31.02 
 
 		 556 aa  186  6e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1813  alpha amylase family protein  29.13 
 
 		 559 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.653374 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1824  putative sucrose phosphorylase  31.7 
 
 		 587 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.552548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0774  Alpha amylase, catalytic region  29.79 
 
 		 589 aa  184  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3210  sucrose phosphorylase  31 
 
 		 596 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0506  putative sucrose phosphorylase  30.41 
 
 		 544 aa  183  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2566  alpha amylase, catalytic region  29.89 
 
 		 578 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0104089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2573  alpha amylase, catalytic region  29.89 
 
 		 578 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000337914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2580  alpha amylase, catalytic region  29.89 
 
 		 578 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.008896  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2588  alpha amylase  29.66 
 
 		 598 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  29.4 
 
 		 584 aa  173  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2243  alpha amylase domain-containing protein  28.77 
 
 		 575 aa  170  6e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2846  alpha amylase, catalytic region  28.27 
 
 		 581 aa  169  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218279  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10441  glycoside hydrolase family protein  27.67 
 
 		 589 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2606  alpha amylase domain-containing protein  29.51 
 
 		 575 aa  163  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08951  glycoside hydrolase family protein  27.79 
 
 		 586 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.497034  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08971  glycoside hydrolase family protein  27.31 
 
 		 586 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.540308  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1523  alpha amylase catalytic region  26.88 
 
 		 561 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.346384  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0246  alpha amylase domain-containing protein  25.38 
 
 		 583 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0838  alpha amylase domain-containing protein  26.85 
 
 		 586 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09141  glycoside hydrolase family protein  25.38 
 
 		 583 aa  153  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264002 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06751  glycoside hydrolase family protein  26.91 
 
 		 578 aa  136  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.335085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  24.95 
 
 		 657 aa  80.5  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  27.56 
 
 		 652 aa  77.8  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  26.87 
 
 		 667 aa  76.6  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  22.98 
 
 		 661 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  25.42 
 
 		 638 aa  74.3  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  27.83 
 
 		 650 aa  73.6  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  26.91 
 
 		 663 aa  73.6  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  23.09 
 
 		 638 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  26.87 
 
 		 646 aa  73.2  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  26.41 
 
 		 1116 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  27.23 
 
 		 636 aa  71.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  33.14 
 
 		 594 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  25.97 
 
 		 1116 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  23.74 
 
 		 651 aa  70.5  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  23.4 
 
 		 650 aa  69.7  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  26.83 
 
 		 1099 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  26.76 
 
 		 649 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  22.52 
 
 		 644 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  26.98 
 
 		 1108 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  26.4 
 
 		 548 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  26.52 
 
 		 551 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  29.35 
 
 		 556 aa  68.2  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  23.19 
 
 		 643 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  25.51 
 
 		 1139 aa  67.4  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  24.05 
 
 		 567 aa  67.4  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  27.08 
 
 		 558 aa  67.4  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  29.89 
 
 		 538 aa  67  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  26.44 
 
 		 1100 aa  67  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  25.21 
 
 		 639 aa  67  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  24.71 
 
 		 562 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  25.77 
 
 		 1111 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  26.37 
 
 		 601 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  25.82 
 
 		 585 aa  65.1  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  31.1 
 
 		 539 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  24.69 
 
 		 651 aa  65.1  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  26.42 
 
 		 1100 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  24.39 
 
 		 1098 aa  65.1  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  25.65 
 
 		 1121 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  23.6 
 
 		 641 aa  64.3  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  24.88 
 
 		 1098 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  27.89 
 
 		 1130 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  24.87 
 
 		 551 aa  63.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3091  trehalose synthase  26.07 
 
 		 582 aa  63.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000061423  hitchhiker  0.00000215015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  21.74 
 
 		 587 aa  63.5  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  24.9 
 
 		 601 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  22.98 
 
 		 553 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  24.08 
 
 		 1092 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  26.04 
 
 		 596 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  22.87 
 
 		 1121 aa  62.4  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>