235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0227 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0227  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 424 aa  860    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.998322  normal  0.257108 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0228  extracellular solute-binding protein  53.25 
 
 		 435 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6533  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1150  extracellular solute-binding protein  56.82 
 
 		 441 aa  468  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  50.37 
 
 		 418 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3428  extracellular solute-binding protein  47.67 
 
 		 425 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4871  extracellular solute-binding protein family 1  39.07 
 
 		 434 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0232  extracellular solute-binding protein  37.68 
 
 		 425 aa  250  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7039  extracellular solute-binding protein  35.48 
 
 		 428 aa  246  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3847  extracellular solute-binding protein family 1  35.41 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00585532  normal  0.205792 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3299  extracellular solute-binding protein  35.15 
 
 		 421 aa  201  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  34.01 
 
 		 426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.45 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.75 
 
 		 431 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 425 aa  82.8  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.67 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  21.95 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  26.78 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  27.09 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  27.09 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3365  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.079846  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.56 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3895  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 420 aa  67  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1269  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 412 aa  67  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 451 aa  67  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.52 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.33 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  28.08 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.45 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3157  extracellular solute-binding protein family 1  27.99 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0206164  normal  0.300299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.88 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.82 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.82 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.57 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.36 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0512  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00024476  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.06 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 433 aa  57  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 397 aa  57  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 443 aa  57  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 447 aa  56.6  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  23.34 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0253  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.85 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 493 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 438 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1702  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>