216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0220 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  84 
 
 		 227 aa  344  5e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  70.65 
 
 		 219 aa  278  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  64.88 
 
 		 204 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  63.5 
 
 		 195 aa  241  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  63.5 
 
 		 195 aa  241  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  60 
 
 		 196 aa  205  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  56.18 
 
 		 198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  48.02 
 
 		 216 aa  186  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  47.2 
 
 		 224 aa  174  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  47.15 
 
 		 245 aa  174  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  48.1 
 
 		 224 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  46.84 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0535  outer membrane protein, OmpW  44.5 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  43.84 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  38.6 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0567  OmpW family protein  42.58 
 
 		 208 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  43.06 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  38.32 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  40 
 
 		 215 aa  141  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  39.69 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  40.21 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  40.62 
 
 		 213 aa  138  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  40.62 
 
 		 221 aa  138  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  44.39 
 
 		 210 aa  137  8.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  39.69 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  39.69 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  39.69 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  41.44 
 
 		 210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  39.82 
 
 		 219 aa  134  8e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  36.22 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  36.22 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  36.22 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  36.22 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  36.22 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  36.22 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  35.9 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  35.9 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0719  OmpW family protein  43.08 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  42.16 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  40.28 
 
 		 229 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  40.54 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  35.65 
 
 		 230 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  39.2 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  39.79 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  39.25 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  41.08 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  34.74 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  40.52 
 
 		 211 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  40.32 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  33.8 
 
 		 217 aa  111  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  36.27 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  36.71 
 
 		 228 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  35.02 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  35.02 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  35.02 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  35.02 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  36.08 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  35.02 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  34.58 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  34.58 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  34.58 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  37.27 
 
 		 200 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  37.27 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  37.27 
 
 		 201 aa  104  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  34.56 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  36.17 
 
 		 227 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  36.17 
 
 		 227 aa  103  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  36.41 
 
 		 227 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  33.8 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  28.89 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2319  OmpW family protein  36.08 
 
 		 243 aa  99.8  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5385  OmpW family protein  34.69 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1326  OmpW family outer membrane protein  36.9 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0285584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  32.68 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  32.79 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1052  OmpW  35.98 
 
 		 211 aa  94.7  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  33.49 
 
 		 213 aa  94.4  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  34.95 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3005  OmpW family protein  34.45 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.561754  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  34.54 
 
 		 210 aa  92  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  33.18 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  32.24 
 
 		 211 aa  92  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  35.89 
 
 		 210 aa  91.7  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0029  OmpW family outer membrane protein  30.83 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  32.56 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  33.64 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  33.64 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  35.58 
 
 		 215 aa  90.5  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  35.65 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  33.33 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  31.61 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  33.33 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  33.79 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  33.33 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  33.94 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  30.92 
 
 		 203 aa  88.6  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  33.18 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  33.18 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  33.18 
 
 		 212 aa  87.8  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>