More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0098 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  283  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  72.86 
 
 		 140 aa  213  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  64.29 
 
 		 140 aa  194  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  68.79 
 
 		 141 aa  193  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  63.57 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  62.14 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1627  UspA domain-containing protein  66.43 
 
 		 140 aa  174  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0944  UspA domain-containing protein  52.86 
 
 		 140 aa  148  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3700  hypothetical protein  50.71 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  52.48 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  40.71 
 
 		 140 aa  121  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2543  UspA domain protein  41.13 
 
 		 141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  38.3 
 
 		 141 aa  87.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  35.51 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  33.81 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3628  UspA domain protein  35.51 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1165  hypothetical protein  31.91 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  31.65 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  32.62 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  28.57 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  34.06 
 
 		 142 aa  67  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  30.71 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.09 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  30.22 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  31.08 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  34 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  32.64 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  31.33 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  32.5 
 
 		 305 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1741  hypothetical protein  32.39 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.447862  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  31.76 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  30.32 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  34.97 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  30.77 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  33.8 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  32.14 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  32 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  28.77 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  35.14 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  25.18 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  29.79 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  27.34 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  31.37 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  28.37 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  30.5 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  29.05 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0501  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 283 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  28.67 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  28 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  35.21 
 
 		 142 aa  57  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  29.79 
 
 		 150 aa  57  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  32.91 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.22 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  25.69 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  33.33 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  29.37 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  35 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1300  universal stress protein  36.25 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  28.78 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  28.78 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4503  hypothetical protein  31.65 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  29.29 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  28.09 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  26.62 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  26.62 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  28.67 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  26.62 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  26.62 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  31.54 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  32.17 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  31.94 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  26.62 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  37.88 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  34.69 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  43.86 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  41.79 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  44.23 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  33.33 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  27.85 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  26.62 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  26.62 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  29.08 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>