More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0092 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
172 aa  349  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  92.73 
 
 
186 aa  311  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  80.61 
 
 
169 aa  278  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  76.97 
 
 
172 aa  264  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  74.71 
 
 
173 aa  256  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  71.95 
 
 
168 aa  241  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  66.88 
 
 
186 aa  229  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  67.5 
 
 
186 aa  229  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  72.39 
 
 
173 aa  228  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  67.08 
 
 
170 aa  221  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  55.03 
 
 
169 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  54.44 
 
 
169 aa  189  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  53.85 
 
 
169 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  53.85 
 
 
169 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  54.44 
 
 
169 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  54.44 
 
 
169 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  54.44 
 
 
169 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  54.44 
 
 
169 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  54.22 
 
 
174 aa  187  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  54.94 
 
 
171 aa  187  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  58.44 
 
 
167 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  55.56 
 
 
171 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  55.56 
 
 
171 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  55.56 
 
 
171 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  55.56 
 
 
171 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  55.56 
 
 
171 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  55.56 
 
 
171 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  55.56 
 
 
171 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  54.27 
 
 
169 aa  184  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  51.16 
 
 
204 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  50.56 
 
 
186 aa  170  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  54.17 
 
 
192 aa  167  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.57 
 
 
192 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  51.48 
 
 
191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  46.24 
 
 
175 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  48.08 
 
 
322 aa  155  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.8 
 
 
166 aa  154  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  47.27 
 
 
175 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  47.27 
 
 
175 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  47.53 
 
 
175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  48.37 
 
 
304 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  49.37 
 
 
180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  50.67 
 
 
174 aa  144  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  46.58 
 
 
175 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  45.51 
 
 
309 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  46.58 
 
 
175 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  46.58 
 
 
175 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  46.62 
 
 
171 aa  141  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  46.15 
 
 
166 aa  141  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  46.75 
 
 
180 aa  140  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  44.59 
 
 
313 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  47.1 
 
 
168 aa  137  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  45.86 
 
 
172 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  45.86 
 
 
172 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  45.58 
 
 
174 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  45.58 
 
 
191 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  45.58 
 
 
191 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  45.27 
 
 
175 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  44.94 
 
 
183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2411  flavin reductase-like, FMN-binding  44.97 
 
 
182 aa  124  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  38.96 
 
 
172 aa  123  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  43.92 
 
 
172 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  36.02 
 
 
186 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  40.13 
 
 
182 aa  121  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.94 
 
 
311 aa  120  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.24 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  41.72 
 
 
408 aa  119  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  43.75 
 
 
170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  37.84 
 
 
163 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  42.67 
 
 
311 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.67 
 
 
184 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  39.07 
 
 
160 aa  114  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  44.36 
 
 
226 aa  114  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  44.36 
 
 
226 aa  114  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  43.51 
 
 
318 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  47.62 
 
 
172 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.22 
 
 
311 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2283  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.94 
 
 
191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153986  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  43.61 
 
 
226 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
311 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  37.34 
 
 
393 aa  111  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  46.21 
 
 
166 aa  111  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.36 
 
 
168 aa  110  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.27 
 
 
311 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  40.74 
 
 
302 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.87 
 
 
160 aa  108  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  35.44 
 
 
188 aa  107  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  41.06 
 
 
170 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.16 
 
 
330 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  39.55 
 
 
306 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8271  flavin reductase domain-containing protein  44.36 
 
 
168 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  42.21 
 
 
164 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  42.95 
 
 
168 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  38.51 
 
 
160 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  35.95 
 
 
172 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  41.22 
 
 
177 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  41.26 
 
 
156 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.87 
 
 
190 aa  105  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.91 
 
 
165 aa  104  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2676  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  47.18 
 
 
204 aa  103  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.80645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>