179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0089 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  100 
 
 
505 aa  1007    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  60.68 
 
 
499 aa  599  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  51.29 
 
 
511 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  51.08 
 
 
512 aa  330  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  50.69 
 
 
512 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  32.86 
 
 
487 aa  202  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  32.42 
 
 
519 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  32.41 
 
 
490 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  31.12 
 
 
514 aa  160  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  32.86 
 
 
511 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  33.74 
 
 
512 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  33.87 
 
 
512 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  32.72 
 
 
512 aa  156  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  33.68 
 
 
540 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  30.57 
 
 
494 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  30.31 
 
 
513 aa  151  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  31.75 
 
 
505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  33.4 
 
 
508 aa  144  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  28.66 
 
 
508 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  32 
 
 
511 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  28.46 
 
 
508 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  29.29 
 
 
508 aa  136  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  31.3 
 
 
596 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  27.99 
 
 
510 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  38.72 
 
 
291 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  32.86 
 
 
510 aa  127  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  32.71 
 
 
505 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  28.89 
 
 
489 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  28.89 
 
 
489 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  28.45 
 
 
494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3579  adenylate cyclase  39.53 
 
 
215 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  39.53 
 
 
215 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  34.64 
 
 
512 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  29.67 
 
 
494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  40.09 
 
 
213 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  36.45 
 
 
505 aa  111  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  29.98 
 
 
498 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  27.16 
 
 
543 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  30.45 
 
 
509 aa  110  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  39.63 
 
 
213 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0648  putative adenylate cyclase  39.63 
 
 
213 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0944  putative adenylate cyclase  39.63 
 
 
213 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1914  putative adenylate cyclase  39.63 
 
 
213 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2913  adenylate cyclase  40.09 
 
 
213 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0350  adenylate cyclase  34.48 
 
 
454 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2702  adenylate cyclase  38.89 
 
 
211 aa  107  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0502  adenylate cyclase  37.85 
 
 
208 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2575  adenylate cyclase  37.85 
 
 
208 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0530  adenylate cyclase  37.85 
 
 
208 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3406  adenylate cyclase  35.43 
 
 
445 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0100742  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  37.34 
 
 
508 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  29.74 
 
 
519 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  40.83 
 
 
286 aa  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  36.48 
 
 
498 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  35.43 
 
 
443 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  33.19 
 
 
433 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  36.48 
 
 
508 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2763  adenylate cyclase  37.9 
 
 
219 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  39.66 
 
 
208 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  33.19 
 
 
433 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  33.19 
 
 
433 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  36.48 
 
 
508 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3128  adenylate cyclase  37.72 
 
 
219 aa  100  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.352745  normal  0.54028 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  36.24 
 
 
503 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  28.95 
 
 
520 aa  98.6  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  32.76 
 
 
433 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3565  adenylate cyclase  34.53 
 
 
443 aa  98.2  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00255763  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  32.26 
 
 
435 aa  97.8  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  32.76 
 
 
433 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  32.9 
 
 
433 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  34.95 
 
 
495 aa  97.8  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  33.91 
 
 
433 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  35.16 
 
 
508 aa  97.4  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  35.94 
 
 
503 aa  97.1  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  27.01 
 
 
510 aa  97.1  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  33.91 
 
 
433 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  33.91 
 
 
433 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  33.91 
 
 
433 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  33.91 
 
 
433 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  33.91 
 
 
433 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  35.32 
 
 
503 aa  96.7  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3617  adenylate cyclase  38.32 
 
 
208 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0457  CyaB/UgiF-like adenylyl cyclase  37.04 
 
 
208 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  27.02 
 
 
502 aa  94.7  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  33.33 
 
 
495 aa  94  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  34.1 
 
 
503 aa  94  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0435  adenylate cyclase  38.03 
 
 
208 aa  94.4  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  32.23 
 
 
529 aa  94  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  32.47 
 
 
433 aa  94  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  32.47 
 
 
433 aa  93.6  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0459  adenylate cyclase  38.03 
 
 
208 aa  93.2  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.211373 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2864  adenylate cyclase  38.5 
 
 
208 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39702  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0718  adenylate cyclase  33.63 
 
 
500 aa  90.9  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00048972  unclonable  0.0000000193925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  26.84 
 
 
521 aa  90.1  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5421  adenylate cyclase  35.43 
 
 
456 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274372  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  26.31 
 
 
504 aa  89.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1189  hypothetical protein  30.41 
 
 
347 aa  89.7  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0252  adenylate cyclase  37.5 
 
 
484 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3182  adenylate cyclase  40.66 
 
 
207 aa  89  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  33.82 
 
 
315 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807346 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>