43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0061 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0061  prevent-host-death family protein  100 
 
 
93 aa  191  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933415  normal  0.536193 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1901  prevent-host-death family protein  48.72 
 
 
78 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00389172  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0085  prevent-host-death family protein  44.87 
 
 
73 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0087  prevent-host-death family protein  44.87 
 
 
73 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.393506  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1782  prevent-host-death family protein  36.9 
 
 
78 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2469  prevent-host-death family protein  61.54 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117875  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5801  prevent-host-death family protein  45.16 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.866899  normal  0.0690534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2762  prevent-host-death family protein  47.62 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.954217  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5571  prevent-host-death family protein  51.11 
 
 
82 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00661607  normal  0.119215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3050  prevent-host-death family protein  47.73 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3369  prevent-host-death family protein  50 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0934085  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  50 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2929  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1318  prevent-host-death family protein  34.88 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.404403  normal  0.571647 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1066  prevent-host-death family protein  47.27 
 
 
78 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2983  prevent-host-death family protein  50.98 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.413921  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2596  prevent-host-death family protein  50.98 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3527  prevent-host-death family protein  47.73 
 
 
82 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378115  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3011  prevent-host-death family protein  48.78 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  47.62 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0212  prevent-host-death family protein  27.91 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.655671  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2221  prevent-host-death family protein  48.08 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2206  prevent-host-death protein  30.68 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.429062  normal  0.232261 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2637  prevent-host-death protein  46.51 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3784  hypothetical protein  48.84 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640007  decreased coverage  0.000191951 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4551  prevent-host-death family protein  43.9 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2929  prevent-host-death family protein  43.9 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.106644 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1315  prevent-host-death family protein  48.84 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147155  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1067  prevent-host-death family protein  46.67 
 
 
76 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.3928  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  42.59 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5532  prevent-host-death protein  45 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.791012  normal  0.352518 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5934  prevent-host-death family protein  45 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0339897  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1777  prevent-host-death family protein  48.78 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3886  prevent-host-death family protein  28.92 
 
 
83 aa  41.2  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  51.28 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2966  prevent-host-death family protein  38.03 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00596285  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  37.31 
 
 
95 aa  40.8  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13419  hypothetical protein  38.6 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000985645  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  38.46 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1621  prevent-host-death family protein  46.34 
 
 
91 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2619  prevent-host-death family protein  45 
 
 
88 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3752  prevent-host-death family protein  41.3 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2939  prevent-host-death family protein  50 
 
 
79 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100426  normal  0.275009 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>