More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0060 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  86.55 
 
 		 394 aa  679    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  78.68 
 
 		 394 aa  650    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  78.43 
 
 		 394 aa  648    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  86.55 
 
 		 394 aa  679    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  86.04 
 
 		 395 aa  683    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  90.1 
 
 		 394 aa  706    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  78.43 
 
 		 394 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  100 
 
 		 394 aa  798    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  96.95 
 
 		 394 aa  756    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  77.92 
 
 		 394 aa  632  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  77.41 
 
 		 394 aa  629  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  76.14 
 
 		 394 aa  627  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  76.65 
 
 		 394 aa  621  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  76.4 
 
 		 394 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  76.14 
 
 		 427 aa  617  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  76.4 
 
 		 394 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  76.4 
 
 		 394 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  76.65 
 
 		 394 aa  620  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  76.4 
 
 		 394 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  76.4 
 
 		 427 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  75.89 
 
 		 394 aa  620  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  76.4 
 
 		 427 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  75.76 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  75.26 
 
 		 409 aa  588  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  76.02 
 
 		 397 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  76.28 
 
 		 397 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  75.77 
 
 		 397 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  75.77 
 
 		 397 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  76.02 
 
 		 397 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  75.77 
 
 		 397 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0377  beta-ketothiolase  74.11 
 
 		 395 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  67.77 
 
 		 396 aa  553  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  68.62 
 
 		 395 aa  544  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  67.35 
 
 		 396 aa  532  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  66.16 
 
 		 394 aa  528  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  65.9 
 
 		 398 aa  522  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0032  beta-ketothiolase  67.35 
 
 		 395 aa  520  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0014  beta-ketothiolase  66.58 
 
 		 395 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6830  acetyl-CoA acetyltransferase  67.51 
 
 		 393 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0332  beta-ketothiolase  64.62 
 
 		 421 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471879  hitchhiker  0.00997806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0025  beta-ketothiolase  66.07 
 
 		 395 aa  508  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  66.33 
 
 		 396 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2149  beta-ketothiolase  63.17 
 
 		 394 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3754  beta-ketothiolase  62.92 
 
 		 394 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  62.66 
 
 		 392 aa  490  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2009  beta-ketothiolase  62.92 
 
 		 394 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0651285  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2196  beta-ketothiolase  64.45 
 
 		 394 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.858736 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5309  acetyl-CoA acetyltransferase  60.1 
 
 		 398 aa  484  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.330072 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16380  acetoacetyl-CoA thiolase  63.68 
 
 		 397 aa  480  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0688  beta-ketothiolase  60.46 
 
 		 395 aa  477  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494591  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0927  beta-ketothiolase  58.63 
 
 		 394 aa  473  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0480332  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0914  beta-ketothiolase  58.12 
 
 		 394 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.579266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2663  beta-ketothiolase  61.99 
 
 		 393 aa  468  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  60.2 
 
 		 389 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  61.22 
 
 		 392 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0262  beta-ketothiolase  60.97 
 
 		 391 aa  462  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2273  beta-ketothiolase  58.12 
 
 		 393 aa  461  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3331  beta-ketothiolase  60.66 
 
 		 394 aa  461  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  57.95 
 
 		 393 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1951  acetyl-CoA acetyltransferase  58.97 
 
 		 393 aa  455  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  57.8 
 
 		 391 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3854  beta-ketothiolase  59.29 
 
 		 395 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3022  beta-ketothiolase  57.25 
 
 		 393 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00935658  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  57.44 
 
 		 393 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0022  beta-ketothiolase  59.85 
 
 		 400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2659  beta-ketothiolase  58.42 
 
 		 393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1354  beta-ketothiolase  59.69 
 
 		 389 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  54.18 
 
 		 402 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  51.53 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  51.53 
 
 		 394 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  51.27 
 
 		 392 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  52.43 
 
 		 390 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  52.42 
 
 		 392 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  51.91 
 
 		 392 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0433  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  50.76 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  50.76 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  50.76 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  51.4 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 392 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  50.76 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2401  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1380  acetyl-CoA acetyltransferase  52.69 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 392 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 392 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  50.76 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0427  acetyl-CoA acetyltransferase  51.27 
 
 		 391 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0745  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 388 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3822  acetyl-CoA acetyltransferase  50.78 
 
 		 393 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 398 aa  378  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.38 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2466  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 		 391 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4344  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 408 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.13 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>