151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0042 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0042  methylglyoxal synthase  100 
 
 		 127 aa  255  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.304097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2382  methylglyoxal synthase  70.34 
 
 		 146 aa  174  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1982  methylglyoxal synthase  70.34 
 
 		 143 aa  174  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2061  methylglyoxal synthase  70.25 
 
 		 129 aa  173  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337955  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1304  methylglyoxal synthase  70.25 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206043  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3256  methylglyoxal synthase  69.42 
 
 		 129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308691  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2185  methylglyoxal synthase  69.17 
 
 		 135 aa  170  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2504  methylglyoxal synthase  71.19 
 
 		 130 aa  166  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5618  methylglyoxal synthase  70.34 
 
 		 130 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0573538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0792  methylglyoxal synthase  70.43 
 
 		 140 aa  160  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52468  normal  0.131121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0987  methylglyoxal synthase  70.34 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1881  methylglyoxal synthase  68.64 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1390  methylglyoxal synthase  68.64 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1079  methylglyoxal synthase  68.64 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.233114  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0788  methylglyoxal synthase  68.64 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0615906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1235  methylglyoxal synthase  68.64 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1244  methylglyoxal synthase  68.64 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0362  methylglyoxal synthase  68.64 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.607553  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2329  methylglyoxal synthase  69.49 
 
 		 130 aa  157  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2207  methylglyoxal synthase  69.49 
 
 		 130 aa  157  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.093882  normal  0.861141 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2291  methylglyoxal synthase  68.64 
 
 		 130 aa  156  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2314  methylglyoxal synthase  68.64 
 
 		 130 aa  156  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.659726 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1018  methylglyoxal synthase  67.8 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.736302  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1679  methylglyoxal synthase  67.8 
 
 		 130 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04890  Dephospho-CoA kinase  61.34 
 
 		 317 aa  152  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544377  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2805  methylglyoxal synthase  61.34 
 
 		 133 aa  152  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.321447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1275  methylglyoxal synthase  60.68 
 
 		 128 aa  146  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.418994  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0524  methylglyoxal synthase  55.74 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1163  methylglyoxal synthase  61.54 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.618904  normal  0.0141735 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1415  methylglyoxal synthase  56.3 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0291451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1416  methylglyoxal synthase  56.3 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.032143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1627  methylglyoxal synthase  56.3 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15767 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0594  methylglyoxal synthase  57.6 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.444681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2123  methylglyoxal synthase  54.62 
 
 		 140 aa  144  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1459  methylglyoxal synthase  55.46 
 
 		 131 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0146321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1443  methylglyoxal synthase  55.46 
 
 		 131 aa  143  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0250107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1556  methylglyoxal synthase  55.46 
 
 		 131 aa  143  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1589  methylglyoxal synthase  55.46 
 
 		 131 aa  143  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1662  methylglyoxal synthase  55.46 
 
 		 131 aa  143  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0967  methylglyoxal synthase  59.17 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3756  methylglyoxal synthase  55.46 
 
 		 131 aa  143  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1700  methylglyoxal synthase  55.46 
 
 		 131 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277502  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2126  methylglyoxal synthase  55.46 
 
 		 132 aa  141  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000882281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1257  methylglyoxal synthase  55.46 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0496  methylglyoxal synthase  55.46 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1122  methylglyoxal synthase  54.31 
 
 		 126 aa  141  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1309  methylglyoxal synthase  56.3 
 
 		 141 aa  141  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.871383  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0366  methylglyoxal synthase  53.39 
 
 		 126 aa  140  8e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0194  methylglyoxal synthase  57.14 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0707  methylglyoxal synthase  53.33 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2484  methylglyoxal synthase  59.83 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1077  methylglyoxal synthase  56.03 
 
 		 119 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1265  methylglyoxal synthase  56.03 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1706  methylglyoxal synthase  56.41 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3178  methylglyoxal synthase  54.7 
 
 		 134 aa  131  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2082  methylglyoxal synthase  50.43 
 
 		 120 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1798  methylglyoxal synthase  55.08 
 
 		 123 aa  130  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061495  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2192  methylglyoxal synthase  55.08 
 
 		 122 aa  130  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_145  methylglyoxal synthase  52.59 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2527  methylglyoxal synthase  51.75 
 
 		 139 aa  127  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0233  methylglyoxal synthase  52.59 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0137  methylglyoxal synthase  53.45 
 
 		 144 aa  127  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0241  methylglyoxal synthase  55.65 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0116  methylglyoxal synthase  48.31 
 
 		 152 aa  124  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503426  normal  0.542869 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1481  methylglyoxal synthase  53 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2651  methylglyoxal synthase  50.82 
 
 		 140 aa  124  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1906  methylglyoxal synthase  47.2 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3450  methylglyoxal synthase  46.03 
 
 		 156 aa  114  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000281554  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000319  methylglyoxal synthase  43.9 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1475  methylglyoxal synthase  45.69 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.977307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1350  methylglyoxal synthase  45.45 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4588  methylglyoxal synthase  47.58 
 
 		 133 aa  114  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1144  methylglyoxal synthase  45.83 
 
 		 155 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175062  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06121  methylglyoxal synthase  43.09 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1760  methylglyoxal synthase  41.94 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0497546  hitchhiker  0.0006316 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2367  methylglyoxal synthase  46.22 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000264399  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3100  methylglyoxal synthase  45 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000537533  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0650  methylglyoxal synthase  41.94 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2133  methylglyoxal synthase  44.74 
 
 		 151 aa  110  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0525885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1302  methylglyoxal synthase  43.8 
 
 		 154 aa  110  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113114  decreased coverage  0.00562878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2381  methylglyoxal synthase  46.96 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0265896  normal  0.0715346 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00967  methylglyoxal synthase  43.97 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2680  methylglyoxal synthase  43.97 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.788486  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1127  methylglyoxal synthase  43.97 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.284898  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00974  hypothetical protein  43.97 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1628  methylglyoxal synthase  44.63 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1072  methylglyoxal synthase  43.97 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000670613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1078  methylglyoxal synthase  43.97 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000897908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2633  methylglyoxal synthase  43.97 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.264102  hitchhiker  0.000000301541 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2156  methylglyoxal synthase  43.97 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.082443  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2352  methylglyoxal synthase  43.97 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.318065  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21210  methylglyoxal synthase  49.58 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846941  normal  0.0527752 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0918  methylglyoxal synthase  39.68 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.502742  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1034  methylglyoxal synthase  43.1 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1139  methylglyoxal synthase  43.1 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.482721 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1151  methylglyoxal synthase  43.1 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1185  methylglyoxal synthase  43.1 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.408572  normal  0.64136 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1117  methylglyoxal synthase  43.1 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000625657 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0611  methylglyoxal synthase  45 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1097  methylglyoxal synthase  38.89 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>