More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0034 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
284 aa  586  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  75.8 
 
 
281 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  55.69 
 
 
298 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  53.94 
 
 
291 aa  275  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  47.08 
 
 
281 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  46.47 
 
 
298 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  45.21 
 
 
286 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  42.61 
 
 
286 aa  229  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  44.06 
 
 
286 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  44.06 
 
 
286 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  48.4 
 
 
327 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  43.39 
 
 
282 aa  217  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  45.35 
 
 
286 aa  215  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  48.02 
 
 
321 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  38.57 
 
 
288 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  44.53 
 
 
367 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  43.09 
 
 
293 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  43.14 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  43.14 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  39.84 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  43.13 
 
 
261 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  41.9 
 
 
257 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  39.2 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  36.82 
 
 
266 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  36.11 
 
 
260 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  37.98 
 
 
290 aa  168  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  41.67 
 
 
254 aa  168  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  37.98 
 
 
267 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  37.59 
 
 
279 aa  166  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  37.16 
 
 
264 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  36.94 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  38.67 
 
 
260 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  36.99 
 
 
310 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  38.19 
 
 
279 aa  158  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  38.19 
 
 
279 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  37.15 
 
 
282 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  38.72 
 
 
270 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  39.57 
 
 
277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  36.51 
 
 
283 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  36.64 
 
 
265 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  37.25 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  36.47 
 
 
266 aa  152  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  39.26 
 
 
272 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  41.31 
 
 
269 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  38.46 
 
 
295 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  37.29 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  36.12 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  39.62 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  38.07 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  36.59 
 
 
276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  38.91 
 
 
289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  36.92 
 
 
282 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  40.25 
 
 
263 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  34.29 
 
 
280 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  36.05 
 
 
261 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  36.59 
 
 
280 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  39.08 
 
 
271 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  35.71 
 
 
267 aa  142  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  39.73 
 
 
273 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  41.23 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  38.21 
 
 
267 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  38.39 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  36.4 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  35.02 
 
 
294 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  35.93 
 
 
268 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  39.6 
 
 
270 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  34.34 
 
 
275 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  35.23 
 
 
269 aa  138  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  39.6 
 
 
270 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  33.46 
 
 
279 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  38.69 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  35.25 
 
 
272 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  35.25 
 
 
272 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  35.25 
 
 
272 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  35.61 
 
 
272 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  38.26 
 
 
292 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  41.35 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  34.73 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  33.07 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  31.66 
 
 
275 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  40.35 
 
 
268 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  32.35 
 
 
268 aa  122  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  32.82 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  35.37 
 
 
280 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  37.41 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  42.74 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  31.39 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  34.56 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  39.09 
 
 
280 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  44.86 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  33.57 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  35.25 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  33.52 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  33.52 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  33.52 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  29.66 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  30.81 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  27.38 
 
 
272 aa  79  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  34.51 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  30.29 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>