More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0029 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0026  sensory histidine kinase CreC  71.85 
 
 		 480 aa  682    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  100 
 
 		 478 aa  955    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0136  sensory histidine kinase CreC  64.91 
 
 		 494 aa  596  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100988  normal  0.318639 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  43.74 
 
 		 475 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1316  sensory histidine kinase CreC  46 
 
 		 477 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  45.38 
 
 		 481 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  43.49 
 
 		 483 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  42.44 
 
 		 483 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  42.44 
 
 		 483 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  42.44 
 
 		 483 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1651  sensory histidine kinase CreC  40.3 
 
 		 481 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4119  sensory histidine kinase CreC  41.09 
 
 		 473 aa  344  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0358  sensory histidine kinase CreC  42.86 
 
 		 478 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0976606  normal  0.775768 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3895  sensory histidine kinase CreC  41.45 
 
 		 472 aa  341  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0569  sensory histidine kinase CreC  40.68 
 
 		 474 aa  339  8e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0349073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0879  sensory histidine kinase CreC  40.72 
 
 		 477 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0876  sensory histidine kinase CreC  40.72 
 
 		 477 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3844  sensory histidine kinase CreC  40.3 
 
 		 472 aa  335  1e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0361  sensory histidine kinase CreC  42.64 
 
 		 478 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261479  normal  0.160502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06070  sensory histidine kinase CreC  40.89 
 
 		 474 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0120862 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0560  sensory histidine kinase CreC  41.19 
 
 		 474 aa  327  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4870  sensory histidine kinase CreC  41.56 
 
 		 477 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.678033  normal  0.269402 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  38.38 
 
 		 474 aa  322  9.000000000000001e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5195  sensory histidine kinase CreC  40.43 
 
 		 472 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251392  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06625  sensory histidine kinase CreC  37.79 
 
 		 481 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1205  sensory histidine kinase CreC  38.98 
 
 		 486 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201777  normal  0.0331356 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4947  sensory histidine kinase CreC  38.51 
 
 		 474 aa  313  5.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04275  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CreB or PhoB, regulator of the CreBC regulon  38.51 
 
 		 474 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04240  hypothetical protein  38.51 
 
 		 474 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4998  sensory histidine kinase CreC  38.51 
 
 		 474 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4635  sensory histidine kinase CreC  38.51 
 
 		 474 aa  311  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4950  sensory histidine kinase CreC  38.51 
 
 		 474 aa  310  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.861306 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3657  sensory histidine kinase CreC  38.3 
 
 		 474 aa  310  5e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.958648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5914  sensory histidine kinase CreC  38.3 
 
 		 474 aa  310  5e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4913  sensory histidine kinase CreC  39.15 
 
 		 474 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4999  sensory histidine kinase CreC  39.15 
 
 		 474 aa  309  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4947  sensory histidine kinase CreC  39.15 
 
 		 474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4840  sensory histidine kinase CreC  39.49 
 
 		 474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.391423  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3598  histidine kinase  38.3 
 
 		 474 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5001  sensory histidine kinase CreC  38.72 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 476 aa  300  4e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.572616  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0317  sensory histidine kinase CreC  38.01 
 
 		 483 aa  281  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5424  sensory histidine kinase CreC  35.92 
 
 		 486 aa  273  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0236  sensory histidine kinase CreC  37.85 
 
 		 465 aa  272  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0965  sensory histidine kinase CreC  29.22 
 
 		 628 aa  229  7e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000960861 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04742  sensor protein CreC  44.44 
 
 		 239 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 945 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  24.43 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  24.43 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  28.28 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 592 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  36.32 
 
 		 919 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1221  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 525 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0121657 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 613 aa  134  5e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  38.99 
 
 		 416 aa  132  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 520 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 516 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 585 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 		 614 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2915  histidine kinase  30.28 
 
 		 457 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 564 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 591 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  33.9 
 
 		 906 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  23.63 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  35.59 
 
 		 425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2885  ATPase domain-containing protein  30.28 
 
 		 462 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466682 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 457 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  23.63 
 
 		 458 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  23.63 
 
 		 458 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 581 aa  126  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 585 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  36.7 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 		 484 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  23.29 
 
 		 458 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  33.18 
 
 		 470 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  22.95 
 
 		 458 aa  124  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  30.07 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  36.7 
 
 		 423 aa  124  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  23.29 
 
 		 458 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  36.99 
 
 		 402 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.78 
 
 		 397 aa  123  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  22.04 
 
 		 458 aa  123  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 493 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  22.95 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  34.36 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 582 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  22.95 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  35.32 
 
 		 465 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  34.82 
 
 		 412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 932 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.42 
 
 		 640 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 479 aa  120  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  31.98 
 
 		 484 aa  120  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  33.33 
 
 		 422 aa  120  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6750  histidine kinase  37.16 
 
 		 394 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479634  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 		 639 aa  119  9e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  36.07 
 
 		 401 aa  119  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 614 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  22.58 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>