14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0017 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0017  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  381  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0029  hypothetical protein  65.43 
 
 
188 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0011  hypothetical protein  51.4 
 
 
181 aa  154  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00169291  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0015  protein of unknown function DUF1520  50.36 
 
 
192 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0023  hypothetical protein  52.8 
 
 
184 aa  101  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0007  hypothetical protein  42.76 
 
 
209 aa  97.8  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.906518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0025  protein of unknown function DUF1520  42.11 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0024  hypothetical protein  56.7 
 
 
187 aa  95.9  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4985  hypothetical protein  38.98 
 
 
189 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1246  hypothetical protein  39.23 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188378  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1386  hypothetical protein  37.61 
 
 
267 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000111197  normal  0.104164 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0257  hypothetical protein  34.51 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.821198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3424  hypothetical protein  36.14 
 
 
138 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  31.03 
 
 
280 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>