85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_R0050 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_R0050  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000000388549  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0017  tRNA-Arg  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0011  tRNA-Arg  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0057  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00400024  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0001  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000193558  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0037  tRNA-Arg  87.67 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000548287  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0004  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0042  tRNA-Arg  87.67 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00669255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0053  tRNA-Arg  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0223382  normal  0.521756 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0036  tRNA-Arg  85.92 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.269516  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0037  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0037  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000022611  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0019  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230793  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0019  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000464578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0099  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.108565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0024  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000167821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000072092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000847547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 80 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000143078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000219464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5726  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000859141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5694  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000635784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0024  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0051  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0104  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0137  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00346099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5664  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000049458  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0133  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000990226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0218  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000264905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5813  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0022  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000027529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5732  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0022  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0101  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00157662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0299  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000767893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0860  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000046411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5028  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000552339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5639  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5672  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0051  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000500778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000407513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 80 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000012583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4997  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0785  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.40314e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0277  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5044  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4571  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000605128  normal  0.110688 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000201078  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0024  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000092316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0014  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000281617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0056  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 80 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000523953  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000123447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0014  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000388984  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0056  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.771364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0024  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0232798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0100  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00184606  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0035  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2650599999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0624  tRNA-Arg  88 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00406719  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0026  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0044  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg01  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 80 bp  50.1  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000810736  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0048  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0048  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00527947  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000884624  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2217  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000193879  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0014  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0054104  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0053  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376557  hitchhiker  8.69297e-22 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0016  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.562679  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0172  tRNA-Arg  86 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.678062  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0065  tRNA-Arg  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.68192e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0035  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0038  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0257046  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0028  tRNA-Arg  86 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0009  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.190028  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0042  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0042  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0118555  normal  0.877407 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0060  tRNA-Arg  82.86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0027  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.360005  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>