78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_R0046 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_R0046  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000283736  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0061  tRNA-Glu  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0032  tRNA-Glu  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.449659  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0034  tRNA-Glu  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0629823  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0043  tRNA-Glu  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000194529  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0084  tRNA-Glu  95 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0050  tRNA-Glu  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1507  tRNA-Glu  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25080  tRNA-Glu  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0027  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.624035  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0002  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.509318 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0029  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0056  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0059  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0071  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0027  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0395147  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0070  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0035  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06180  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.75789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0006  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766786  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0005  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0033  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0516198  hitchhiker  0.000000402532 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0052  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0022  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.845779 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0053  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.526279 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0052  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0002  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00548293  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0039  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000141026  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0038  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.012292  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0055  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0056  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116328  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0059  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.872199  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0046  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.404692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0045  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.427459  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34010  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284833  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11080  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0010  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0051  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.63793  hitchhiker  0.00823145 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0037  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0094  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.453938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0077  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0010  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373505  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1919  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  normal  0.292752 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0042  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446717  normal  0.0208603 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0052  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.822673  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4216  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133179  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt26  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt27  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt26  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt27  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0045  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0001  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0034  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGlu01  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.484379  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGlu02  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGlu03  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0060  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.790027  normal  0.68606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0020  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4190  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00029698  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4194  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000043379  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0038  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000180021  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4284  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489125  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2009  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0054  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0186416  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0008  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.114306  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0036  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0894618  normal  0.0649973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0097  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000137842  hitchhiker  0.00043068 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0108  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0206919  unclonable  0.0000000263061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0062  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.216976  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0186  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0014  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000370587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3401  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0670786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3472  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00023531  normal  0.785224 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0066  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000193579  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0009  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000494179  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0012  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000289432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>