174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1936 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
1911 aa  3807    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 
1621 aa  396  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  30.55 
 
 
982 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 
1779 aa  364  8e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  30.08 
 
 
934 aa  305  4.0000000000000003e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  28.94 
 
 
1141 aa  288  5e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 
1083 aa  249  4.9999999999999997e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  28.11 
 
 
962 aa  247  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  37.33 
 
 
1219 aa  246  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 
1321 aa  233  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
1711 aa  230  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 
1544 aa  230  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  32.16 
 
 
724 aa  223  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 
1448 aa  189  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  33.52 
 
 
596 aa  176  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  31.23 
 
 
599 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 
1869 aa  160  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
1247 aa  157  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  33.33 
 
 
992 aa  157  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
994 aa  155  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  21.04 
 
 
2059 aa  140  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  29.25 
 
 
552 aa  133  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  36.62 
 
 
737 aa  124  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  31.29 
 
 
720 aa  124  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
1502 aa  119  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  23.11 
 
 
1040 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  36.36 
 
 
720 aa  111  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  28.35 
 
 
490 aa  111  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2800  hypothetical protein  28.14 
 
 
720 aa  109  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000115328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 
422 aa  109  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.96 
 
 
1288 aa  107  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  33.87 
 
 
460 aa  106  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  32.48 
 
 
393 aa  105  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  23.08 
 
 
1914 aa  105  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 
878 aa  103  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  24.21 
 
 
985 aa  101  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  28.85 
 
 
560 aa  99  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  19.92 
 
 
1261 aa  97.4  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.07 
 
 
1694 aa  96.7  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  23.65 
 
 
1238 aa  96.3  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.46 
 
 
810 aa  94.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 
1714 aa  94  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  21.25 
 
 
2145 aa  93.2  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.88 
 
 
1737 aa  92.4  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 
1054 aa  92  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 
649 aa  89.7  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  22.47 
 
 
782 aa  86.7  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  26.24 
 
 
445 aa  85.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  25.87 
 
 
714 aa  84  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  23.41 
 
 
1266 aa  84.7  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  36.17 
 
 
322 aa  84.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  36.17 
 
 
322 aa  84.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  31.46 
 
 
326 aa  82.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  20.97 
 
 
1082 aa  82.4  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  32.08 
 
 
326 aa  79.7  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  32.08 
 
 
326 aa  79.7  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.94 
 
 
1056 aa  79.3  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21 
 
 
988 aa  78.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  25.78 
 
 
476 aa  77.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.91 
 
 
3301 aa  78.2  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  22.71 
 
 
887 aa  78.2  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  32.82 
 
 
341 aa  76.3  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.59 
 
 
1486 aa  75.9  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  33.1 
 
 
337 aa  75.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  22.99 
 
 
1087 aa  74.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  33.15 
 
 
325 aa  73.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  29.63 
 
 
327 aa  73.2  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  30.13 
 
 
325 aa  70.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  22.92 
 
 
1611 aa  70.5  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  22.75 
 
 
1154 aa  70.5  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.31 
 
 
991 aa  70.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0048  tetratricopeptide domain-containing protein  22.44 
 
 
897 aa  67.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 
3172 aa  67.4  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  24.82 
 
 
1123 aa  66.6  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.84 
 
 
818 aa  64.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  31.14 
 
 
332 aa  63.9  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  24.4 
 
 
1131 aa  63.2  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 
909 aa  63.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  22.76 
 
 
1213 aa  63.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.52 
 
 
784 aa  63.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 
639 aa  62.4  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.05 
 
 
636 aa  62.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.12 
 
 
644 aa  62  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.73 
 
 
1279 aa  62  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  30.16 
 
 
501 aa  62  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  21.92 
 
 
681 aa  60.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  21.67 
 
 
2327 aa  60.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  25.54 
 
 
405 aa  60.1  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2801  hypothetical protein  35.87 
 
 
341 aa  60.1  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  hitchhiker  0.0000289447 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 
949 aa  60.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  21.34 
 
 
448 aa  59.7  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.06 
 
 
1022 aa  59.3  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 
927 aa  58.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 
714 aa  58.2  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43024  predicted protein  22.44 
 
 
576 aa  58.2  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000321984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.87 
 
 
730 aa  58.2  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  25.59 
 
 
682 aa  58.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  22.97 
 
 
919 aa  57  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  29.19 
 
 
425 aa  57.4  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  24.84 
 
 
985 aa  56.6  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>