More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1905 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1905  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  100 
 
 		 347 aa  716    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0212666  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  52.48 
 
 		 343 aa  397  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  53.06 
 
 		 343 aa  395  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1699  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.13 
 
 		 348 aa  394  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.41 
 
 		 340 aa  388  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1388  radical SAM enzyme, Cfr family  43.95 
 
 		 462 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.33 
 
 		 347 aa  302  6.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.04 
 
 		 347 aa  302  7.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.27 
 
 		 349 aa  299  4e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  46.67 
 
 		 348 aa  299  4e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.7 
 
 		 342 aa  291  8e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  45.68 
 
 		 349 aa  288  7e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.29 
 
 		 341 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.65 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  42.66 
 
 		 357 aa  278  8e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.79 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1533  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.39 
 
 		 349 aa  276  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.27 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.27 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  42.61 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2022  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.84 
 
 		 371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.39 
 
 		 346 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000061721  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0426  radical SAM enzyme, Cfr family  42.26 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.74 
 
 		 344 aa  272  5.000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  42.61 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1581  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.35 
 
 		 343 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000011547  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  40.71 
 
 		 349 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.03 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3850  radical SAM enzyme, Cfr family  40.4 
 
 		 357 aa  270  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  39.38 
 
 		 359 aa  268  8.999999999999999e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1323  radical SAM enzyme, Cfr family  38.33 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28470  radical SAM enzyme, Cfr family  41.67 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.267861  hitchhiker  0.00294853 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0620  hypothetical protein  42.69 
 
 		 370 aa  266  4e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.77 
 
 		 362 aa  265  7e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.77 
 
 		 362 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.77 
 
 		 362 aa  265  7e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.77 
 
 		 362 aa  265  7e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.77 
 
 		 362 aa  265  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.77 
 
 		 362 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.77 
 
 		 362 aa  265  8e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2243  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.51 
 
 		 359 aa  265  8e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.726084 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.6 
 
 		 362 aa  265  8e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.77 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3115  radical SAM enzyme, Cfr family  40.88 
 
 		 353 aa  263  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.248396  hitchhiker  0.0000000842526 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0427  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.84 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2558  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.82 
 
 		 351 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.150479999999999e-35 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2379  hypothetical protein  39.15 
 
 		 365 aa  263  3e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  41.69 
 
 		 371 aa  263  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  40.35 
 
 		 377 aa  262  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.77 
 
 		 362 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.82 
 
 		 351 aa  262  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0167472  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0596  radical SAM enzyme, Cfr family  40.64 
 
 		 353 aa  262  8e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3329  hypothetical protein  40.88 
 
 		 428 aa  262  8e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1111  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0269  hypothetical protein  42.6 
 
 		 410 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1249  radical SAM protein  40.24 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1721  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.33 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.428537  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  40.06 
 
 		 376 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2012  radical SAM enzyme, Cfr family  41.11 
 
 		 357 aa  260  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2505  radical SAM protein  42.77 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282858  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.19 
 
 		 362 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1431  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.83 
 
 		 367 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1660  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.17 
 
 		 389 aa  259  4e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  40.36 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  39.52 
 
 		 360 aa  259  7e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3311  radical SAM enzyme  41.74 
 
 		 406 aa  258  7e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.853243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0679  hypothetical protein  41.6 
 
 		 409 aa  258  8e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0461  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.17 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.745055  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  40.23 
 
 		 364 aa  257  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1743  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.39 
 
 		 358 aa  256  3e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.499617  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  41.14 
 
 		 375 aa  256  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0445  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.2 
 
 		 386 aa  256  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0648  hypothetical protein  40.44 
 
 		 413 aa  256  5e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.68 
 
 		 371 aa  256  5e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  40.79 
 
 		 350 aa  255  9e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0458  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.96 
 
 		 368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2967  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.71 
 
 		 358 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0788473  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  40.8 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  39.53 
 
 		 344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.96 
 
 		 351 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40320  hypothetical protein  40.23 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666991  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2311  radical SAM protein  41.49 
 
 		 371 aa  253  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  38.19 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4182  radical SAM protein  40.87 
 
 		 374 aa  253  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0021  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.83 
 
 		 356 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1816  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.27 
 
 		 354 aa  252  5.000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1590  radical SAM protein  38.73 
 
 		 318 aa  252  6e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3089  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.89 
 
 		 360 aa  252  7e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.929572  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4604  hypothetical protein  37.68 
 
 		 382 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3129  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.83 
 
 		 380 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3393  radical SAM enzyme, Cfr family  39.04 
 
 		 382 aa  252  8.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  37.68 
 
 		 369 aa  251  9.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1431  radical SAM enzyme, Cfr family  37.9 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0591  hypothetical protein  37.47 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.196855  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.3 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3503  radical SAM protein  38.78 
 
 		 382 aa  250  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.4 
 
 		 381 aa  250  2e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1431  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 398 aa  250  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2191  radical SAM enzyme, Cfr family  41.11 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4731  radical SAM enzyme, Cfr family  41.03 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.698724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>