64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1881 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1881  CRISPR-associated Csh2 family protein  100 
 
 		 302 aa  616  1e-175  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.576122  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2520  hypothetical protein  55.97 
 
 		 301 aa  357  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3202  CRISPR-associated Csh2 family protein  44.55 
 
 		 305 aa  242  6e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1019  CRISPR-associated Csh2 family protein  43.38 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1184  CRISPR-associated protein, Csh2 family  40.07 
 
 		 318 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0623  CRISPR-associated protein, Csh2 family  42.96 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0306  CRISPR-associated protein, Csh2 family  42.48 
 
 		 318 aa  205  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0639  CRISPR-associated Csh2 family protein  38.54 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00285412  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1072  CRISPR-associated Csh2 family protein  40.66 
 
 		 330 aa  190  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.618984  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0938  CRISPR-associated Csh2 family protein  36.79 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1292  CRISPR-associated protein, Csh2 family  33.77 
 
 		 306 aa  159  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1420  CRISPR-associated protein, Csh2 family  34.38 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0231  CRISPR-associated Csh2 family protein  34.12 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.748958  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2426  CRISPR-associated protein, Csh2 family  28.43 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0614729  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2325  CRISPR-associated Csh2 family protein  33.83 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2663  CRISPR-associated protein, Csh2 family  33.67 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2834  CRISPR-associated protein, Csh2 family  28.99 
 
 		 351 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3938  CRISPR-associated protein, CT1132 family  30.57 
 
 		 316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1453  CRISPR-associated protein, Csh2 family  31.31 
 
 		 359 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15240  CRISPR-associated protein, Csh2 family  32.75 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.105097  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0269  CRISPR-associated Csh2 family protein  28.25 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0537  CRISPR-associated Csh2 family protein  29.13 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3331  CRISPR-associated protein, Csh2 family  26.82 
 
 		 340 aa  112  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0770  CRISPR-associated Csh2 family protein  31.46 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4290  CRISPR-associated protein, CT1132 family  28.15 
 
 		 356 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0973  CRISPR-associated protein, Csh2 family  28.53 
 
 		 334 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1298  CRISPR-associated Csh2 family protein  26 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.841348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1067  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.93 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0472036 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0654  CRISPR-associated Csh2 family protein  29.67 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2975  CRISPR-associated Csd2 family protein  27.56 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1158  CRISPR-associated Csd2 family protein  26.98 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0236  CRISPR-associated Csd2 family protein  26.37 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3522  CRISPR-associated Csd2 family protein  29.8 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1486  Csd2 family CRISPR-associated protein  35.38 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3579  Csd2 family CRISPR-associated protein  29.27 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3382  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr1 family  34.88 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.860383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3344  CRISPR-associated Csh2 family protein  29.85 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00748339  normal  0.380655 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0353  hypothetical protein  26.35 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.171823  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0604  CRISPR-associated Csh2 family protein  29.72 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.520474  normal  0.472142 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1938  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.27 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.364907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31600  CRISPR-associated protein Csd2  25.32 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02698  crispr-associated protein, Csd2 family  26.7 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0847  hypothetical protein  27.45 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0831  CRISPR-associated Csd2 family protein  27.15 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1007  CRISPR-associated Csh2 family protein  27.85 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.143713  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1480  CRISPR-associated protein, Csd2 family  27.27 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0478  hypothetical protein  28.25 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3648  CRISPR-associated protein, Csd2 family  34.25 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1005  CRISPR-associated Csd2 family protein  26.09 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1631  CRISPR-associated protein, Csd2 family  28.5 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.835293  normal  0.948126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0495  CRISPR-associated Csh2 family protein  26.48 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1976  CRISPR-associated protein, Csd2 family  26.58 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.856064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0823  CRISPR-associated protein, Csd2 family  26.79 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3904  CRISPR-associated Csh2 family protein  28.31 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.264914  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1726  CRISPR-associated Csd2 family protein  30 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1974  CRISPR-associated protein, Csd2 family  24.79 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1433  CRISPR-associated Csd2 family protein  39.68 
 
 		 366 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.562068  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1660  CRISPR-associated protein, Csd2 family  44.07 
 
 		 346 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0398  hypothetical protein  28.5 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00253922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0795  CRISPR-associated protein TM1801  26.73 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4332  CRISPR-associated Csd2 family protein  47.06 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000155089  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3004  hypothetical protein  27.92 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1123  hypothetical protein  32.14 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.011418  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3868  CRISPR-associated protein TM1801  30 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>