50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1878 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 
170 aa  343  5e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  41.46 
 
 
165 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  39.51 
 
 
178 aa  145  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  40.74 
 
 
169 aa  141  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  39.51 
 
 
169 aa  138  4e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  41.46 
 
 
169 aa  134  7e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.27 
 
 
168 aa  127  9e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  43.29 
 
 
168 aa  125  4e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  37.42 
 
 
162 aa  124  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  38.89 
 
 
168 aa  124  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  35.15 
 
 
185 aa  123  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  34.57 
 
 
177 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  33.53 
 
 
165 aa  120  1e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.76 
 
 
165 aa  119  2e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.2 
 
 
163 aa  119  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1022  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.56 
 
 
159 aa  115  4e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  39.51 
 
 
161 aa  114  7e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  3.34057e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.36 
 
 
170 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.81 
 
 
158 aa  105  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  31.9 
 
 
169 aa  94.4  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.93 
 
 
173 aa  91.7  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.12 
 
 
199 aa  85.1  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  26.35 
 
 
171 aa  80.9  8e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  29.88 
 
 
199 aa  78.6  4e-14  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.48 
 
 
172 aa  78.2  5e-14  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  25.77 
 
 
186 aa  77.8  6e-14  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  29.7 
 
 
165 aa  77.8  7e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  27.71 
 
 
162 aa  73.6  1e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.67 
 
 
165 aa  72.8  2e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.83 
 
 
177 aa  72  4e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  27.61 
 
 
189 aa  70.9  8e-12  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  28.31 
 
 
167 aa  70.9  8e-12  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  26.99 
 
 
192 aa  70.5  1e-11  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  27.44 
 
 
163 aa  70.5  1e-11  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  26.51 
 
 
169 aa  68.9  4e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  25.15 
 
 
172 aa  67.8  7e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  23.89 
 
 
180 aa  65.9  3e-10  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  28.48 
 
 
162 aa  65.5  3e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  1.76613e-06 
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.64 
 
 
170 aa  64.3  9e-10  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  28.74 
 
 
161 aa  62.8  2e-09  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  31.33 
 
 
166 aa  62.4  3e-09  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1391  hypothetical protein  23.49 
 
 
171 aa  60.5  1e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.268781  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  32.93 
 
 
162 aa  59.7  2e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0395  CRISPR-associated protein Cas4  32.59 
 
 
127 aa  55.8  2e-07  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0424779  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  25.75 
 
 
166 aa  49.3  2e-05  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  24.85 
 
 
165 aa  48.5  4e-05  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  26.32 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.97 
 
 
550 aa  45.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  1.41365e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  22.16 
 
 
200 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  24.04 
 
 
214 aa  41.6  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>