More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1830 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 488 aa  993    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 469 aa  566  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 469 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  55.09 
 
 		 473 aa  535  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 469 aa  530  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 490 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 482 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 496 aa  392  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 479 aa  391  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 477 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 491 aa  388  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 488 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 481 aa  382  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 490 aa  382  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 488 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 490 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 485 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 464 aa  369  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 486 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 491 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  42.44 
 
 		 546 aa  367  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 478 aa  365  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 501 aa  365  1e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 491 aa  362  6e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 464 aa  363  6e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 491 aa  361  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 485 aa  360  3e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 485 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 485 aa  360  3e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 485 aa  360  3e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 485 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 485 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  39.51 
 
 		 495 aa  360  3e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 485 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 491 aa  356  5e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 484 aa  354  2e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 480 aa  351  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 484 aa  351  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 484 aa  351  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 504 aa  350  3e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 488 aa  349  6e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 492 aa  347  3e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 498 aa  341  2e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 499 aa  340  2.9999999999999998e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 		 495 aa  333  4e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 		 465 aa  333  5e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 468 aa  332  7.000000000000001e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 495 aa  332  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 483 aa  332  1e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 480 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 535 aa  331  2e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 487 aa  330  4e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 484 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 		 466 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 484 aa  327  3e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 472 aa  327  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 470 aa  327  3e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 		 506 aa  326  5e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  38.99 
 
 		 518 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 476 aa  323  3e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 490 aa  322  6e-87  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 		 492 aa  323  6e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 473 aa  322  9.999999999999999e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0592  glutamyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 467 aa  322  9.999999999999999e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 		 481 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 481 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  35.66 
 
 		 494 aa  320  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1176  glutamyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 462 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 473 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 471 aa  320  3.9999999999999996e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 475 aa  320  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 464 aa  319  7e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0113  glutamyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 484 aa  318  9e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 483 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 467 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 484 aa  317  2e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 472 aa  317  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 464 aa  317  3e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 467 aa  317  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf641  glutamyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 464 aa  317  3e-85  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 470 aa  316  5e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 471 aa  316  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 471 aa  316  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 492 aa  316  6e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 466 aa  316  6e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 483 aa  316  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 493 aa  316  6e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 469 aa  315  9e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_52655  glutamyl-trna synthase  45.09 
 
 		 588 aa  314  1.9999999999999998e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233509  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 490 aa  315  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 		 493 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 466 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>